More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4456 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4456  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477354  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4976  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  96.86 
 
 
318 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0615  lipolytic protein  86.48 
 
 
318 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5236  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  83.65 
 
 
318 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3319  Alpha/beta hydrolase fold-3  83.65 
 
 
318 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.571151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5048  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  83.65 
 
 
318 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3592  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  82.41 
 
 
326 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3965  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  76.1 
 
 
309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0494  putative lipase  66.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2132  lipase (esterase)  66.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0983  putative lipase  66.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1955  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.97 
 
 
319 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0764  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.97 
 
 
319 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  66.36 
 
 
319 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1845  lipase, putative  66.26 
 
 
318 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0824  putative lipase (esterase)  60.82 
 
 
319 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.529506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3282  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  59.94 
 
 
311 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4506  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  57.99 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0370  lipolytic protein  42.45 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2185  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.33 
 
 
312 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.208041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6169  putative lipolytic enzyme  44.36 
 
 
331 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71110  putative lipolytic enzyme  44.73 
 
 
331 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1826  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.63 
 
 
315 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0590291  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.73 
 
 
314 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4504  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.07 
 
 
303 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0564939  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.08 
 
 
318 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2246  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.05 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.8 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 
317 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1186  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.58 
 
 
311 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  34.69 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.38 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.89 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0592  putative lipase/esterase  41.06 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.56 
 
 
311 aa  132  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5077  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.78 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0300585  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.83 
 
 
376 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.88 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  36.02 
 
 
314 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.17 
 
 
310 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.77 
 
 
628 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 
301 aa  129  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.4 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.52 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.04 
 
 
313 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.75 
 
 
314 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.56 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1620  lipolytic protein  37.55 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0105415  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.83 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.83 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3269  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  39.34 
 
 
328 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0772  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.88 
 
 
312 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000370345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  37.61 
 
 
320 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.04 
 
 
371 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.29 
 
 
323 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6421  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19712  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  34.7 
 
 
321 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2512  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.06 
 
 
317 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.119667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1835  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.13 
 
 
319 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.19 
 
 
346 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2861  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.77 
 
 
301 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.91 
 
 
310 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1807  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.8 
 
 
319 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086728  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3606  putative esterase/lipase  31.37 
 
 
317 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0140226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.05 
 
 
307 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.05 
 
 
314 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0443  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.5 
 
 
371 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.63 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.35 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6181  Alpha/beta hydrolase fold-3  31.27 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1898  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2542  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.91 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5198  esterase/lipase/thioesterase  31.73 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.379534 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.33 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1549  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.31 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149777  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0324  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.19 
 
 
308 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.79 
 
 
352 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1376  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.04 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  34.32 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.55 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1921  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.27 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.458098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.96 
 
 
340 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.51 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.21 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6232  esterase/lipase/thioesterase  37.06 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.11 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  33.59 
 
 
312 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.03 
 
 
310 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05191  esterase/lipase protein  35.15 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00691331  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.26 
 
 
375 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  37.55 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1756  lipolytic enzyme  35.22 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3916  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.88 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.19 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0645  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.38 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.19 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.19 
 
 
321 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>