148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1246 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  41 
 
 
299 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  44.44 
 
 
245 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  41.96 
 
 
269 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  41.86 
 
 
262 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  35.55 
 
 
263 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  39.75 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  37.73 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  38.79 
 
 
261 aa  124  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  36.82 
 
 
271 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  37.5 
 
 
331 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  31.82 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  38.27 
 
 
268 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  36.29 
 
 
249 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  37.6 
 
 
262 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  35.69 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  38.37 
 
 
273 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  36.63 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  40.09 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  45.68 
 
 
264 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  40.61 
 
 
279 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  37.85 
 
 
332 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  36.76 
 
 
344 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  30.45 
 
 
307 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  36.44 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  35.65 
 
 
292 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  36.44 
 
 
355 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.57 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  38.39 
 
 
380 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  32.38 
 
 
379 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  33 
 
 
309 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  40.18 
 
 
399 aa  82  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  40.11 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1048  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.35 
 
 
316 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  29.13 
 
 
326 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.43 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  32.57 
 
 
283 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  28.07 
 
 
411 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  30 
 
 
308 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.85 
 
 
762 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.31 
 
 
726 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.68 
 
 
307 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.72 
 
 
407 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.72 
 
 
311 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.96 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.7 
 
 
692 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  25.93 
 
 
409 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.32 
 
 
677 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.25 
 
 
648 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
668 aa  52  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
278 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 
284 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  28.38 
 
 
618 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
678 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  31.06 
 
 
593 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.34 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00830  esterase/lipase  33.05 
 
 
454 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.41 
 
 
697 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  26.72 
 
 
403 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  31.34 
 
 
323 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
708 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  29.09 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  26.1 
 
 
407 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.1 
 
 
407 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  30.41 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.63 
 
 
716 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.7 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
700 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.85 
 
 
312 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.06 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  26.35 
 
 
264 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.83 
 
 
701 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.47 
 
 
313 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.1 
 
 
407 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  35 
 
 
256 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1764  putative hydrolase  29.23 
 
 
261 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35222  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.53 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  33.52 
 
 
281 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  32.54 
 
 
345 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.93 
 
 
720 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.06 
 
 
695 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2246  alpha/beta fold family hydrolase  27.91 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  30.35 
 
 
431 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.45 
 
 
655 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3625  putative esterase  27.98 
 
 
283 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000216129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.67 
 
 
661 aa  45.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.21 
 
 
712 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  30.88 
 
 
376 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27440  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.7 
 
 
681 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  29.1 
 
 
306 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  28.24 
 
 
309 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0653  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  32.65 
 
 
262 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  28.65 
 
 
306 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  25.13 
 
 
648 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
283 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.6 
 
 
652 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  26.83 
 
 
300 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.58 
 
 
672 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>