100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2006 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  100 
 
 
309 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  40.16 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  39.83 
 
 
273 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  34.73 
 
 
263 aa  132  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  32.17 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  35.06 
 
 
355 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  34.68 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  38.18 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  42.14 
 
 
261 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.19 
 
 
331 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  29.24 
 
 
270 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  33.07 
 
 
292 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  33.05 
 
 
322 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  33.55 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  35.67 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  27.46 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  35.26 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  29.44 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.93 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  29.58 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  36.73 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  33.94 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  39.66 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  28.14 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  47.5 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  29.29 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  28.79 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.07 
 
 
1094 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.36 
 
 
343 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  29.6 
 
 
471 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  32.48 
 
 
321 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  27.55 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.99 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  31.36 
 
 
593 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  33.6 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  26.25 
 
 
325 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  36.94 
 
 
276 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.73 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1052  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.15 
 
 
322 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  32.63 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  28.65 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  26.09 
 
 
411 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  28.93 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.91 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  29.86 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  26.32 
 
 
379 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  29.33 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1434  Esterase/lipase-like protein  26.05 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 
645 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  29.33 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  32.04 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  23.12 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.53 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.11 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  33.63 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  26.81 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  28.07 
 
 
474 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  31.78 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  22.88 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  23.96 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.43 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  23.29 
 
 
644 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2048  esterase/lipase  27.53 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1865  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.44 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.39 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.46 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.85 
 
 
406 aa  45.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  30.82 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  30.67 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  32.56 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5130  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.58 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  28.93 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  31.82 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  29.93 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2759  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.44 
 
 
336 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0114  lipase/esterase, putative  32.04 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.04 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13750  esterase/lipase  24.45 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197009  normal  0.100761 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  27.45 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  25.65 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.89 
 
 
719 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  30.25 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.37 
 
 
607 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  25.81 
 
 
344 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2009  acylaminoacyl-peptidase  27.37 
 
 
618 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.951277  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  30 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  32.04 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.29 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1874  acetyl esterase/ sugar hydrolase  25.58 
 
 
338 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169934  hitchhiker  0.00141165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0545  esterase/lipase  27.27 
 
 
311 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  28.19 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3444  LipQ  28.38 
 
 
274 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.24 
 
 
608 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>