297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2922 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  100 
 
 		 307 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  38.68 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  34.85 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  29.92 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  33.2 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  34.94 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  33.72 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  32.82 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  29.34 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.31 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.02 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  26.79 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  28.52 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  29.13 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  31.44 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  30.38 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  27.46 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  30.34 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  27.91 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  28.79 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  33.55 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  26.69 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.63 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  28.91 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  29.51 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  28.68 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  28.74 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  30.53 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.56 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.95 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.85 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0511  LipQ  30.74 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122421  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.49 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.49 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.49 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  31.89 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.64 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3283  esterase/lipase-like protein  29.05 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0945103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  28.07 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  22.6 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  27.97 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  26.69 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  23.15 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1292  esterase/lipase  33.33 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  28.76 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25.73 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.37 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  27.59 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1764  putative hydrolase  29.44 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.35 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  26.46 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.16 
 
 		 795 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.64 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  27.67 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.16 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  32.03 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.95 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.73 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.78 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.78 
 
 		 607 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  28.88 
 
 		 786 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4431  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.14 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31619  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4321  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.14 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 		 827 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  26.75 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  28.37 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3106  esterase/lipase/thioesterase  26.5 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 		 826 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  25.56 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0733  esterase/lipase  29.41 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000565641  normal  0.048904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.67 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1482  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.37 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.03 
 
 		 652 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  27.18 
 
 		 826 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 		 827 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.48 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2205  hypothetical protein  29.63 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.900633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  26.99 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6775  esterase/lipase/thioesterase  38.95 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1241  putative lipoprotein  25.62 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.045623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  24.26 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 		 826 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.58 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 		 826 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1801  hypothetical protein  29.63 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.94 
 
 		 1094 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 		 789 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  26.46 
 
 		 735 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 		 829 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1910  hypothetical protein  29.63 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.11 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 		 826 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>