More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4159 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.28 
 
 
826 aa  1308    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
827 aa  1717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  50.24 
 
 
819 aa  808    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  73.52 
 
 
826 aa  1310    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  74.49 
 
 
826 aa  1327    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  69.77 
 
 
828 aa  1245    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.76 
 
 
831 aa  1415    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  50.06 
 
 
850 aa  852    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.61 
 
 
826 aa  1316    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  48.44 
 
 
831 aa  810    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.73 
 
 
826 aa  1330    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.24 
 
 
826 aa  1311    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  71.29 
 
 
829 aa  1288    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.73 
 
 
826 aa  1320    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  70.33 
 
 
824 aa  1234    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.49 
 
 
826 aa  1325    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.12 
 
 
823 aa  1312    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.14 
 
 
828 aa  1375    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.44 
 
 
827 aa  1414    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.98 
 
 
789 aa  595  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.51 
 
 
795 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  39.12 
 
 
795 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  38.77 
 
 
786 aa  554  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2851  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.15 
 
 
811 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342438  normal  0.410655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.18 
 
 
800 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1969  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.93 
 
 
787 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  31.23 
 
 
741 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.11 
 
 
735 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.96 
 
 
767 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.17 
 
 
771 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.8 
 
 
750 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.74 
 
 
766 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  29.28 
 
 
763 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.74 
 
 
771 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  29.65 
 
 
763 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.07 
 
 
760 aa  178  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  27.55 
 
 
752 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.23 
 
 
768 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  29.22 
 
 
763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  29.22 
 
 
763 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.78 
 
 
765 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  28.88 
 
 
775 aa  174  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.85 
 
 
748 aa  174  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.68 
 
 
733 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  28.05 
 
 
768 aa  172  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  29.44 
 
 
729 aa  170  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.32 
 
 
771 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.58 
 
 
723 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.89 
 
 
767 aa  167  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.98 
 
 
812 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.06 
 
 
741 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.25 
 
 
751 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.15 
 
 
737 aa  157  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.48 
 
 
721 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.08 
 
 
709 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  26.46 
 
 
754 aa  152  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.09 
 
 
750 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.18 
 
 
721 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.26 
 
 
739 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.91 
 
 
724 aa  144  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  24.83 
 
 
732 aa  144  8e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  27.69 
 
 
723 aa  137  9e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  32.05 
 
 
568 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  25 
 
 
747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  23.37 
 
 
757 aa  129  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  28.64 
 
 
711 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  33.95 
 
 
711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.88 
 
 
738 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  34.72 
 
 
228 aa  121  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3912  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.22 
 
 
701 aa  120  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.87 
 
 
692 aa  118  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.88 
 
 
725 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.44 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24 
 
 
718 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.89 
 
 
688 aa  110  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  32.56 
 
 
689 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.28 
 
 
678 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.75 
 
 
617 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.42 
 
 
732 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.95 
 
 
726 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.22 
 
 
732 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
655 aa  107  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
655 aa  107  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
654 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
655 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
654 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.84 
 
 
615 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.12 
 
 
693 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  25.18 
 
 
1006 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.5 
 
 
735 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01445  peptidase  26.75 
 
 
779 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  28.53 
 
 
655 aa  104  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  23.72 
 
 
657 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06438  hypothetical dipeptidyl aminopeptidase (Eurofung)  27.86 
 
 
773 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  27.59 
 
 
652 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 
654 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2346  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.88 
 
 
708 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.185642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.27 
 
 
653 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.33 
 
 
600 aa  101  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0346  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  26.67 
 
 
764 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.435892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>