244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1873 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1873  lipase/esterase  100 
 
 
264 aa  501  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1574  hypothetical protein  48.39 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.452675  decreased coverage  0.00256052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0106  hypothetical protein  46.92 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  46.72 
 
 
261 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0331  hypothetical protein  45.42 
 
 
269 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0197  hypothetical protein  45.79 
 
 
245 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1768  esterase/lipase  36.86 
 
 
263 aa  152  8e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  44.27 
 
 
332 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21310  hypothetical protein  38.96 
 
 
271 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3437  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  41.54 
 
 
331 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4325  hypothetical protein  43.32 
 
 
279 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3362  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.37 
 
 
243 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1246  hypothetical protein  46.09 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1424  hypothetical protein  38.58 
 
 
273 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  41.6 
 
 
262 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2569  hypothetical protein  42.06 
 
 
344 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0112  hypothetical protein  40.77 
 
 
270 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237819  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  39 
 
 
268 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0661  hypothetical protein  41.94 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.458296  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6578  esterase/lipase-like protein  38.17 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1516  putative hydrolase  31.66 
 
 
270 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5037  hypothetical protein  40.94 
 
 
268 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0490595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3374  esterase/lipase-like protein  37.5 
 
 
292 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0679  putative lipase/esterase  36.36 
 
 
249 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318798  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1669  esterase/lipase-like protein  35.77 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3160  hypothetical protein  37.2 
 
 
261 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1987  esterase/lipase-like protein  34.83 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1863  putative esterase  41.6 
 
 
380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0663647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2006  esterase/lipase-like protein  33.88 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2922  putative lipase/esterase  32.43 
 
 
307 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  37.5 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2763  hypothetical protein  31.36 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.15873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02409  putative lipase/esterase  34 
 
 
379 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  38.96 
 
 
399 aa  87.8  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2611  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.24 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.985192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2966  esterase/lipase  30.04 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  33.09 
 
 
593 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0978  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.04 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.689687  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3176  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.03 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.57 
 
 
1094 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  29.82 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.82 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3997  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.96 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.82 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2850  putative lipase/esterase  29.95 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6997  dienelactone hydrolase  29.79 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1132  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  27.57 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.58 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4201  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.13 
 
 
645 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.538787  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  33.64 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0837  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.53 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0927814  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1051  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.74 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.696352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0449  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.71 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1655  esterase/lipase-like protein  28.63 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  27.96 
 
 
339 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.09 
 
 
409 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  27.59 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1589  esterase/lipase-like protein  28.63 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.39 
 
 
426 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 
701 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12306  esterase lipM  30.15 
 
 
431 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.9 
 
 
420 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.4 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4020  hypothetical protein  26.99 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  33.06 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.31 
 
 
412 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  28.57 
 
 
471 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6817  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  33.19 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00810  prolyl oligopeptidase family protein  31.22 
 
 
345 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  28.29 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1454  esterase/lipase/thioesterase  29.26 
 
 
411 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0950589  hitchhiker  0.0024577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.77 
 
 
422 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25096  predicted protein  28.51 
 
 
424 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.13 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  29.44 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2156  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.32 
 
 
311 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  35.14 
 
 
324 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1034  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.16 
 
 
321 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  29.87 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.98 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  32.77 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1645  Esterase/lipase-like protein  30.38 
 
 
333 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0204  LipO  29.46 
 
 
414 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0213  LipO  29.46 
 
 
414 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.715409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0751  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  31.03 
 
 
720 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00616106  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1922  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  27.19 
 
 
347 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000977803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  31.98 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0193  LipO  29.46 
 
 
414 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1531  Esterase/lipase-like protein  28.14 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0758048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3157  esterase/lipase-like  31.43 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.48 
 
 
575 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0800  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  27.78 
 
 
321 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1833  esterase-like protein  23.97 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  32.14 
 
 
420 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  29.44 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  25.31 
 
 
644 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  27.68 
 
 
403 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8360  Esterase/lipase-like protein  28.51 
 
 
362 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>