74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0126 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.1 
 
 		 315 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.1 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.72 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  30.95 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.48 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  29.11 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  26.46 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.46 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  31.84 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.72 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.52 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  32.24 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.32 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  22.9 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.36 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  23.57 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  25.56 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.19 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  24.65 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.89 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  29.3 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.85 
 
 		 346 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  28.84 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.36 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  22.52 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  28.84 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  23.78 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.84 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  21.83 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.5 
 
 		 619 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  27.94 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.17 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28.57 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2192  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 		 701 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0268398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.85 
 
 		 649 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  27.13 
 
 		 467 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.94 
 
 		 735 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  29.32 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.93 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  31.75 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  27.76 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30 
 
 		 648 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  37.84 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1342  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.35 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.38743  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.32 
 
 		 623 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.77 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4430  hypothetical protein  37.21 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4124  hypothetical protein  37.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1082  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  22.84 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.75 
 
 		 1094 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4414  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.38 
 
 		 211 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.74 
 
 		 776 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  24.2 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  25.21 
 
 		 681 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  22.8 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>