62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3438 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  100 
 
 
346 aa  717    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  26.51 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  28.9 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  27.68 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  24.34 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.99 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  22.85 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.3 
 
 
311 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 
259 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.85 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.51 
 
 
302 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
297 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.82 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  25.9 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  21.3 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.4 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  21.27 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.09 
 
 
280 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  27.13 
 
 
405 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  38.46 
 
 
670 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  38.46 
 
 
670 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.35 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 
650 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.94 
 
 
292 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  24.62 
 
 
309 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  27.5 
 
 
317 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
372 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.09 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.18 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  27.52 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.08 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00228  hypothetical protein  23.44 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  22.22 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  22.89 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  28.15 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.4 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.61 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  23.18 
 
 
867 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  23.58 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  22.95 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  27.52 
 
 
642 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.4 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  24.61 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  24.73 
 
 
256 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  24.77 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  22.54 
 
 
216 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.71 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  36.78 
 
 
677 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  26.61 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0444  esterase  25.35 
 
 
250 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  25.17 
 
 
223 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.62 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.32 
 
 
677 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
295 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.58 
 
 
314 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  34.38 
 
 
674 aa  42.7  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>