198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0385 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  487  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  38.06 
 
 
294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  27.99 
 
 
313 aa  85.5  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  28.37 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  27.15 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  26.46 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  32.19 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  27.19 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  27.44 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  26.94 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  26.99 
 
 
282 aa  79  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.01 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  26.73 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  26.91 
 
 
337 aa  79  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  33.8 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 
319 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.79 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  23.75 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  27.82 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  32.16 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  23.62 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  34.57 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.72 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  23.33 
 
 
265 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 
317 aa  72  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  29.17 
 
 
271 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  33.2 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.74 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  26.74 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  27.52 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  26.85 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  26.85 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  26.85 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  27.52 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  27.52 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  26.85 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  27.52 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  24.29 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  25.51 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  22.51 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  25.71 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.8 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.74 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  26.72 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  30.33 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  22.22 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  33.72 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.05 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  28.66 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  27.02 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.55 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  24.4 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  40.71 
 
 
424 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  24.11 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0588  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.92 
 
 
345 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.123084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  26.7 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  33.82 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.42 
 
 
644 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.25 
 
 
302 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  31.47 
 
 
310 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.06 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  31.36 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28.46 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.59 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  29.27 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  23.93 
 
 
329 aa  59.3  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl482  putative lipase  24.48 
 
 
381 aa  58.9  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.41792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.98 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  28.29 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.11 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  31.55 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 
685 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  30.74 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.33 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  28.11 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  27.24 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  23.32 
 
 
267 aa  55.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  29.37 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.14 
 
 
316 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.74 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  34.84 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  33.48 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  27.57 
 
 
306 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  27.09 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  24.15 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  24.39 
 
 
347 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  26.87 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  24.15 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  29.84 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  24.15 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  30.71 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  30.71 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.69 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>