45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1570 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  58.25 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  53.68 
 
 
318 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.57 
 
 
285 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  48.08 
 
 
292 aa  261  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.29 
 
 
288 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  44.14 
 
 
304 aa  228  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
280 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.98 
 
 
262 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
264 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  29.17 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  38.98 
 
 
131 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  32.68 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  21.45 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.81 
 
 
585 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  36.11 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.54 
 
 
451 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 
259 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  35.14 
 
 
615 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  27.11 
 
 
614 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  29.85 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  28.65 
 
 
631 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  31.61 
 
 
592 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  24.54 
 
 
597 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  28.06 
 
 
592 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  28.03 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  34.69 
 
 
246 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.09 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
374 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  33.33 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  25.12 
 
 
638 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  25.12 
 
 
638 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  23.68 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  27.55 
 
 
618 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  34.04 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  27.57 
 
 
636 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
1103 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  19.67 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  36.36 
 
 
474 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  29.46 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  28.99 
 
 
618 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>