82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0478 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  25.48 
 
 
316 aa  87  3e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.6 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.23 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  29.7 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  31.58 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  30.94 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  26.59 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  21.58 
 
 
259 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  18.95 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.18 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  24.88 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.24 
 
 
258 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2293  hypothetical protein  34.04 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.661266  normal  0.0651715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  26.61 
 
 
638 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  22.37 
 
 
274 aa  49.7  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  25.19 
 
 
321 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  35.64 
 
 
248 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.77 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1715  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 
307 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.352882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  32.17 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  27.27 
 
 
634 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.66 
 
 
383 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2740  Acetyl xylan esterase  30.07 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.559874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
868 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  32.04 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  26.06 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
274 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1100  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.08 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  27.78 
 
 
415 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  27.78 
 
 
415 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.58 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  35.79 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  27.78 
 
 
415 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  25 
 
 
580 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  35.79 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  28.8 
 
 
442 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.74 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.51 
 
 
288 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  23.53 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  30.23 
 
 
474 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  28.06 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  34.88 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  27.52 
 
 
638 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.61 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  26.56 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.77 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  25.83 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  27.5 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  24.23 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  31.93 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.09 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0401  hypothetical protein  26.91 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.90509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4237  lysophospholipase-like protein  25.64 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  22.86 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  28.72 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04030  hypothetical protein  25.56 
 
 
339 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  34.07 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  24.78 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  30.3 
 
 
704 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  25.39 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  32.35 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  21.67 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 
257 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
254 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  22.92 
 
 
618 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>