181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0936 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  100 
 
 		 704 aa  1435    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  44.79 
 
 		 677 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  44.71 
 
 		 714 aa  555  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  44.43 
 
 		 678 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  43.39 
 
 		 677 aa  527  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  42.23 
 
 		 668 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  41.3 
 
 		 677 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  39.79 
 
 		 670 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  42.99 
 
 		 677 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  40.45 
 
 		 673 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  39.04 
 
 		 670 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  41.55 
 
 		 679 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  39.49 
 
 		 667 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  38.08 
 
 		 690 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  38.21 
 
 		 663 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  39.91 
 
 		 674 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  38.21 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  37.95 
 
 		 674 aa  439  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  38.44 
 
 		 690 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  39.22 
 
 		 667 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  39.33 
 
 		 667 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  36.61 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  34.56 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  34.27 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  35.83 
 
 		 667 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  35.47 
 
 		 665 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  34.55 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  35.51 
 
 		 668 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  32.51 
 
 		 711 aa  338  2.9999999999999997e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  35.96 
 
 		 745 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  34.89 
 
 		 705 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.28 
 
 		 594 aa  150  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.66 
 
 		 585 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.24 
 
 		 534 aa  137  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.86 
 
 		 625 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  25.27 
 
 		 571 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25.82 
 
 		 644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  27.68 
 
 		 615 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.82 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.98 
 
 		 595 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.44 
 
 		 647 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.09 
 
 		 553 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  27.47 
 
 		 555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  27.09 
 
 		 612 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.17 
 
 		 668 aa  114  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.92 
 
 		 550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.84 
 
 		 529 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  26.57 
 
 		 576 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  22.57 
 
 		 542 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.53 
 
 		 668 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.46 
 
 		 547 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.56 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.26 
 
 		 588 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 546 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.37 
 
 		 576 aa  97.8  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  22.35 
 
 		 541 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.29 
 
 		 545 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  22.35 
 
 		 541 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  22.58 
 
 		 630 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.79 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  24.5 
 
 		 569 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.76 
 
 		 568 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.85 
 
 		 644 aa  87.4  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.61 
 
 		 641 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  26.62 
 
 		 557 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.69 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  22.94 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.16 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.84 
 
 		 678 aa  83.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.33 
 
 		 560 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  21.87 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  30.52 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  21.27 
 
 		 625 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.24 
 
 		 673 aa  80.1  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2618  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.05 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.16 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  23.62 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2588  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.05 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.07 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  21.5 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.86 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2860  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.86 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  22.62 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2865  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.86 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  24.9 
 
 		 686 aa  76.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.86 
 
 		 597 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 591 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2908  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.68 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.27 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.12 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2873  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.06 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  22.5 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.13 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.25 
 
 		 607 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.28 
 
 		 584 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  35.33 
 
 		 763 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.08 
 
 		 611 aa  72  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.74 
 
 		 629 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.39 
 
 		 666 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.87 
 
 		 570 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>