167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3114 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  100 
 
 		 560 aa  1146    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  47.37 
 
 		 569 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  47.74 
 
 		 599 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  47.21 
 
 		 598 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  39.96 
 
 		 793 aa  349  8e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.74 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.74 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  33.22 
 
 		 561 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  33.83 
 
 		 599 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  31.25 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  32.62 
 
 		 608 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  30.15 
 
 		 588 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 		 591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.33 
 
 		 609 aa  158  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.31 
 
 		 611 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.07 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.86 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.28 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.22 
 
 		 595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.34 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.29 
 
 		 587 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  27.5 
 
 		 763 aa  134  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.6 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  24.55 
 
 		 547 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.17 
 
 		 595 aa  130  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.76 
 
 		 678 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 604 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  28.15 
 
 		 576 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  35.96 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.98 
 
 		 668 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  26.74 
 
 		 644 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  25.65 
 
 		 571 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  29.6 
 
 		 679 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  25.3 
 
 		 655 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  25.61 
 
 		 668 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  23.36 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  36.08 
 
 		 673 aa  99  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  22.63 
 
 		 663 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.18 
 
 		 677 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  27 
 
 		 677 aa  94.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  36 
 
 		 553 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25.91 
 
 		 668 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.44 
 
 		 615 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  23.17 
 
 		 542 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  25.5 
 
 		 677 aa  88.2  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  30.77 
 
 		 782 aa  88.2  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.05 
 
 		 668 aa  87.4  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  31.63 
 
 		 686 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  23.9 
 
 		 670 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.49 
 
 		 570 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  24.09 
 
 		 679 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  36.15 
 
 		 612 aa  84.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  25.38 
 
 		 680 aa  83.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.45 
 
 		 670 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.14 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  25.33 
 
 		 704 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.46 
 
 		 645 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  22.44 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  29.95 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  23.46 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.46 
 
 		 626 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  34.08 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  21.88 
 
 		 541 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  21.88 
 
 		 541 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  22.26 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  23.6 
 
 		 555 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  32.11 
 
 		 690 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  25.35 
 
 		 705 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  33.71 
 
 		 673 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  24.46 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  32.2 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  34.5 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.12 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.78 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.05 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.63 
 
 		 577 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.89 
 
 		 625 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  29.85 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  29.46 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  22.6 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.65 
 
 		 588 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  33.33 
 
 		 667 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  30.2 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.56 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.58 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  28.7 
 
 		 665 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  24.19 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.03 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  22.91 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.81 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.45 
 
 		 546 aa  64.3  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  42.53 
 
 		 636 aa  63.9  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  30.69 
 
 		 690 aa  63.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  31.21 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  29.38 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  41.3 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  19.17 
 
 		 525 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  27.8 
 
 		 544 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  27.07 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>