167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2359 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  100 
 
 
595 aa  1195    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  43.96 
 
 
571 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  37.33 
 
 
595 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  40.17 
 
 
594 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.65 
 
 
524 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  41.9 
 
 
550 aa  351  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  41.3 
 
 
576 aa  342  8e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  35.13 
 
 
547 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  37.61 
 
 
577 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.72 
 
 
588 aa  293  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.99 
 
 
587 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  35.23 
 
 
557 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.04 
 
 
545 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.47 
 
 
561 aa  270  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.63 
 
 
580 aa  263  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.65 
 
 
529 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  30.82 
 
 
542 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  30.91 
 
 
553 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.77 
 
 
568 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.87 
 
 
625 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  29.37 
 
 
540 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  30.52 
 
 
541 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  30.52 
 
 
541 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.77 
 
 
550 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.14 
 
 
647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.22 
 
 
546 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  33.45 
 
 
571 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  31.69 
 
 
558 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  30.45 
 
 
700 aa  200  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.69 
 
 
611 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.78 
 
 
542 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.87 
 
 
534 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  32.52 
 
 
499 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  33.51 
 
 
549 aa  189  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  25.08 
 
 
617 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  26.5 
 
 
641 aa  180  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.29 
 
 
653 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  30.71 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  26.78 
 
 
558 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  26.78 
 
 
630 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  30.36 
 
 
556 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  26.65 
 
 
625 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  30.65 
 
 
545 aa  171  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  30 
 
 
537 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  30.56 
 
 
551 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  30.56 
 
 
551 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  30.56 
 
 
551 aa  170  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  27.16 
 
 
638 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  30.02 
 
 
544 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.53 
 
 
629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.92 
 
 
663 aa  164  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  27.33 
 
 
668 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  28.46 
 
 
660 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.13 
 
 
645 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  26.48 
 
 
673 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  26.63 
 
 
529 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  27.62 
 
 
637 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  28 
 
 
668 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  28 
 
 
637 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.13 
 
 
585 aa  144  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.07 
 
 
641 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.41 
 
 
643 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  27.35 
 
 
644 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  24.73 
 
 
663 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  23.16 
 
 
618 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  27.37 
 
 
670 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  26.33 
 
 
670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  28.28 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  28 
 
 
680 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  27.66 
 
 
678 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.02 
 
 
678 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0021  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 
525 aa  130  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.17 
 
 
560 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.32 
 
 
576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.92 
 
 
673 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  28.05 
 
 
677 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06411  acyl esterase  27.24 
 
 
525 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.741059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  24.78 
 
 
526 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.16 
 
 
679 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  25.27 
 
 
524 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  27.06 
 
 
670 aa  126  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  24.82 
 
 
704 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.34 
 
 
599 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  28.03 
 
 
705 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.83 
 
 
677 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.06 
 
 
534 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  25.68 
 
 
679 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  30.52 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  26.03 
 
 
677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  24.05 
 
 
526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.83 
 
 
667 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  30.81 
 
 
548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  24.82 
 
 
667 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  26.35 
 
 
531 aa  120  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  27.81 
 
 
668 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  31.01 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.8 
 
 
714 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  27.46 
 
 
674 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  24.77 
 
 
525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  25.41 
 
 
665 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>