140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3107 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  58.89 
 
 
627 aa  710    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  55.59 
 
 
643 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  68.13 
 
 
637 aa  867    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  63.91 
 
 
660 aa  853    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  100 
 
 
641 aa  1315    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  63.75 
 
 
663 aa  853    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  65.16 
 
 
637 aa  860    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  64.2 
 
 
645 aa  861    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  60.29 
 
 
670 aa  753    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  39.03 
 
 
630 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  39.26 
 
 
625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  39.17 
 
 
638 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  38.73 
 
 
700 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  36.82 
 
 
617 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.47 
 
 
629 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.42 
 
 
666 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  35.53 
 
 
641 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  34.83 
 
 
618 aa  327  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.98 
 
 
588 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  30.35 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.11 
 
 
594 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.44 
 
 
595 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  27.59 
 
 
547 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.22 
 
 
587 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.83 
 
 
625 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  29.12 
 
 
557 aa  163  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  28.14 
 
 
571 aa  159  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.15 
 
 
647 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.97 
 
 
550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.18 
 
 
524 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  28.07 
 
 
595 aa  143  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.67 
 
 
611 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.53 
 
 
577 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.37 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  26.81 
 
 
540 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  27.07 
 
 
553 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.96 
 
 
529 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.29 
 
 
545 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  25.62 
 
 
558 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  28.08 
 
 
653 aa  103  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  25.2 
 
 
541 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.37 
 
 
549 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  25.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  24.21 
 
 
670 aa  97.8  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.03 
 
 
670 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.78 
 
 
534 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.2 
 
 
668 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  26.05 
 
 
547 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.82 
 
 
550 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  23.86 
 
 
542 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  26.43 
 
 
545 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.82 
 
 
542 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  26.21 
 
 
550 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.46 
 
 
580 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  36.99 
 
 
556 aa  88.6  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.21 
 
 
668 aa  87.8  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  23.37 
 
 
679 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  23.39 
 
 
636 aa  85.5  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  25.41 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  23.88 
 
 
705 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  24.87 
 
 
667 aa  84  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  24.17 
 
 
668 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.56 
 
 
582 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  25.99 
 
 
571 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  21.31 
 
 
534 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  26.98 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  23.18 
 
 
678 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.7 
 
 
568 aa  79.7  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.86 
 
 
546 aa  77.8  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.04 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  21.89 
 
 
677 aa  77  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  23.51 
 
 
650 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  21.91 
 
 
677 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  25.41 
 
 
547 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  23.23 
 
 
663 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  22.16 
 
 
668 aa  75.1  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  24.87 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  22.78 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  22.78 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  22.78 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  27.36 
 
 
628 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.79 
 
 
626 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.79 
 
 
626 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  22.74 
 
 
674 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.55 
 
 
673 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  23.81 
 
 
714 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  22.22 
 
 
680 aa  72.4  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.49 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  22.42 
 
 
529 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  23.5 
 
 
690 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  22.87 
 
 
665 aa  68.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  22.65 
 
 
677 aa  68.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  22.35 
 
 
677 aa  68.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  24.42 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  21.79 
 
 
667 aa  67.8  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  23.2 
 
 
667 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  32.32 
 
 
544 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  23.2 
 
 
674 aa  63.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  24.64 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.06 
 
 
615 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>