190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1945 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  100 
 
 
630 aa  1315    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  57.42 
 
 
625 aa  708    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  49.18 
 
 
641 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  49.1 
 
 
617 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  45.74 
 
 
638 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  47.03 
 
 
666 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  46.03 
 
 
700 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  46.14 
 
 
618 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  43.42 
 
 
629 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  39.03 
 
 
641 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  39.56 
 
 
643 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  37.5 
 
 
637 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.29 
 
 
645 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  37.76 
 
 
663 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  37.76 
 
 
660 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  37.79 
 
 
670 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  38.13 
 
 
637 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  38.14 
 
 
627 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.24 
 
 
595 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  26.87 
 
 
576 aa  190  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  26.83 
 
 
571 aa  176  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.71 
 
 
550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  25.25 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.78 
 
 
595 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.79 
 
 
594 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.67 
 
 
588 aa  170  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.86 
 
 
587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.16 
 
 
625 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  26.14 
 
 
557 aa  157  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  27.55 
 
 
542 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.07 
 
 
577 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.57 
 
 
561 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  26.71 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  26.71 
 
 
541 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.55 
 
 
553 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  26.63 
 
 
540 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.72 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  24.09 
 
 
537 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  23.92 
 
 
663 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.16 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.43 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.09 
 
 
653 aa  114  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.21 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.44 
 
 
542 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.49 
 
 
668 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.37 
 
 
668 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.33 
 
 
545 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  21.64 
 
 
677 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.09 
 
 
645 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  23.25 
 
 
626 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.25 
 
 
626 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  22.97 
 
 
677 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  24.91 
 
 
549 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  23.8 
 
 
670 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.83 
 
 
568 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25 
 
 
524 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  21.51 
 
 
679 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  21.94 
 
 
668 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  26 
 
 
499 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  24.47 
 
 
644 aa  97.4  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  23.08 
 
 
670 aa  97.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  23.85 
 
 
547 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  21.8 
 
 
668 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  21.52 
 
 
628 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.57 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.23 
 
 
558 aa  95.5  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  21.55 
 
 
667 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  23.39 
 
 
667 aa  94.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  21.68 
 
 
690 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  22.58 
 
 
704 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.7 
 
 
550 aa  91.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  21.31 
 
 
678 aa  89.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.7 
 
 
534 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  22.62 
 
 
612 aa  88.2  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  21.91 
 
 
667 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  22.93 
 
 
548 aa  87  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  22.11 
 
 
674 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  23.79 
 
 
571 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.58 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  22.05 
 
 
674 aa  84.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  21.71 
 
 
667 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  22.29 
 
 
714 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  21.24 
 
 
677 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  22.08 
 
 
673 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  21.71 
 
 
667 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  22.48 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.03 
 
 
582 aa  82  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  22.53 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  22.89 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  21.38 
 
 
650 aa  80.9  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  20.28 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  30.05 
 
 
705 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  21.12 
 
 
680 aa  77.8  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  19.05 
 
 
534 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.36 
 
 
576 aa  77.4  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  23.05 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  33.33 
 
 
556 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  23.79 
 
 
673 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  22.62 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  20.45 
 
 
665 aa  74.3  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>