208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2913 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  100 
 
 
677 aa  1357    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  52.49 
 
 
677 aa  714    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  55.67 
 
 
667 aa  735    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  59.44 
 
 
677 aa  813    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  55.64 
 
 
680 aa  738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  51.09 
 
 
677 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  56.19 
 
 
670 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  49.56 
 
 
678 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  56.36 
 
 
679 aa  763    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  63.22 
 
 
674 aa  847    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  63.07 
 
 
673 aa  858    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  55.98 
 
 
670 aa  791    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  47.19 
 
 
668 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  44.56 
 
 
690 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  44.07 
 
 
674 aa  565  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  46.34 
 
 
690 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  45.78 
 
 
714 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  41.3 
 
 
663 aa  558  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  40.41 
 
 
665 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  40.68 
 
 
667 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  42.46 
 
 
668 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  39.49 
 
 
667 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  41.72 
 
 
667 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  42.99 
 
 
704 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  41.29 
 
 
667 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  37.65 
 
 
670 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  37.04 
 
 
670 aa  479  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  38.81 
 
 
650 aa  452  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  36.29 
 
 
711 aa  438  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  41.22 
 
 
745 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  35.07 
 
 
705 aa  347  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  30.87 
 
 
571 aa  164  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.55 
 
 
594 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.56 
 
 
647 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.76 
 
 
534 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.21 
 
 
625 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.61 
 
 
550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.34 
 
 
595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  30.07 
 
 
576 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.4 
 
 
553 aa  134  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  28.11 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  28.16 
 
 
612 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  29.6 
 
 
557 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.37 
 
 
611 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.06 
 
 
576 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.62 
 
 
547 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.6 
 
 
588 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  23.92 
 
 
542 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.03 
 
 
595 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25.26 
 
 
644 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25 
 
 
668 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.24 
 
 
605 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  22.93 
 
 
541 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.12 
 
 
541 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.87 
 
 
668 aa  120  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  28.27 
 
 
615 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.48 
 
 
587 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.33 
 
 
585 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  24.29 
 
 
686 aa  114  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.97 
 
 
561 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  30.81 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  21.88 
 
 
540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.22 
 
 
653 aa  112  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  25.75 
 
 
673 aa  111  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  22.22 
 
 
582 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.14 
 
 
577 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.21 
 
 
546 aa  106  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  26.33 
 
 
627 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.93 
 
 
549 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  25.42 
 
 
655 aa  101  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  25.43 
 
 
545 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  27.53 
 
 
571 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  29.7 
 
 
503 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.76 
 
 
558 aa  98.2  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.95 
 
 
643 aa  97.8  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.95 
 
 
580 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.71 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.72 
 
 
625 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.25 
 
 
678 aa  95.1  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  25.7 
 
 
551 aa  94.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  25.7 
 
 
551 aa  94.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  25.7 
 
 
551 aa  94.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.01 
 
 
604 aa  93.2  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.38 
 
 
568 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  22.15 
 
 
641 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  22.74 
 
 
625 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.5 
 
 
542 aa  90.5  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.84 
 
 
611 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  24.28 
 
 
679 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.06 
 
 
550 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  24.05 
 
 
529 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.27 
 
 
644 aa  88.2  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.15 
 
 
629 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  20.85 
 
 
618 aa  87.4  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.5 
 
 
609 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 
588 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  24.58 
 
 
544 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.54 
 
 
534 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  21.24 
 
 
630 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  24.12 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>