147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4534 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  62.96 
 
 
611 aa  720    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1249    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.63 
 
 
625 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  33.12 
 
 
763 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  28.83 
 
 
782 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  28.33 
 
 
560 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  25.56 
 
 
668 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.04 
 
 
668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.83 
 
 
599 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.8 
 
 
569 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  26.31 
 
 
598 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  29.28 
 
 
599 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  25.75 
 
 
793 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.83 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.83 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.13 
 
 
605 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  24.45 
 
 
644 aa  107  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  24.9 
 
 
608 aa  107  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.2 
 
 
678 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  26.83 
 
 
571 aa  104  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.59 
 
 
595 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.88 
 
 
547 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  25.24 
 
 
663 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.85 
 
 
581 aa  101  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.99 
 
 
561 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  27.91 
 
 
576 aa  97.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  26.04 
 
 
679 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.79 
 
 
594 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.7 
 
 
570 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  26.32 
 
 
714 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  24.39 
 
 
668 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.66 
 
 
576 aa  92.8  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  26.38 
 
 
668 aa  92  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  22.61 
 
 
541 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.54 
 
 
677 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  25.35 
 
 
655 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.28 
 
 
550 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  22.61 
 
 
541 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.5 
 
 
677 aa  87  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  24.91 
 
 
670 aa  87  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  24.76 
 
 
677 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  24.5 
 
 
670 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  22.5 
 
 
542 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  29.08 
 
 
553 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.5 
 
 
611 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  25.05 
 
 
667 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.91 
 
 
580 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.82 
 
 
595 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  23.56 
 
 
588 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  35.17 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.66 
 
 
667 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  21.98 
 
 
540 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  23.37 
 
 
686 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.77 
 
 
673 aa  78.2  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  21.77 
 
 
636 aa  78.2  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  23.35 
 
 
677 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  24.21 
 
 
680 aa  77.8  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  35.85 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.19 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  24.49 
 
 
665 aa  74.7  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  24.91 
 
 
678 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  36.49 
 
 
555 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
591 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  33.12 
 
 
674 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  22.01 
 
 
670 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.4 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  31.17 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  31.13 
 
 
650 aa  71.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  34.4 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  31.01 
 
 
612 aa  71.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.4 
 
 
626 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.52 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.78 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  39.68 
 
 
587 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  29.9 
 
 
705 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  25.38 
 
 
690 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  24.43 
 
 
674 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  31.76 
 
 
628 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  24.49 
 
 
549 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  23.33 
 
 
690 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  30.67 
 
 
667 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  31.76 
 
 
670 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  30.57 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  29.45 
 
 
615 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  22.76 
 
 
679 aa  65.1  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.74 
 
 
607 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  32.45 
 
 
537 aa  64.3  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3229  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.42 
 
 
656 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5138  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.42 
 
 
656 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  23.65 
 
 
644 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  30.25 
 
 
557 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  29.19 
 
 
667 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  29.19 
 
 
667 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.16 
 
 
653 aa  61.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5144  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.21 
 
 
656 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.19 
 
 
584 aa  60.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.3 
 
 
625 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  26.2 
 
 
547 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  30.92 
 
 
704 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0505  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.4 
 
 
651 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>