166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3241 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  100 
 
 
587 aa  1198    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.49 
 
 
595 aa  343  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  38.73 
 
 
588 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.07 
 
 
594 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  35.79 
 
 
547 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  41.28 
 
 
550 aa  318  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  38.01 
 
 
571 aa  310  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  37.75 
 
 
576 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  33.99 
 
 
595 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.66 
 
 
577 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.83 
 
 
524 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.7 
 
 
647 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  33.9 
 
 
557 aa  238  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.37 
 
 
580 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.92 
 
 
534 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  29.55 
 
 
542 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.74 
 
 
561 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  29.26 
 
 
540 aa  231  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.23 
 
 
625 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.3 
 
 
550 aa  220  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.11 
 
 
568 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.94 
 
 
542 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.08 
 
 
545 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  28.36 
 
 
653 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  29.71 
 
 
553 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.19 
 
 
529 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.25 
 
 
611 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  30.38 
 
 
549 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  30 
 
 
541 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  30 
 
 
541 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  28.74 
 
 
558 aa  188  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.64 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  30.5 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  25.79 
 
 
617 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  27.49 
 
 
641 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  29.93 
 
 
571 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  30.43 
 
 
547 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  30.46 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  30.46 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  30.46 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  30.49 
 
 
550 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.22 
 
 
641 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  26.14 
 
 
625 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  27.78 
 
 
637 aa  170  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  30.56 
 
 
548 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  26.86 
 
 
630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.22 
 
 
663 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  27.06 
 
 
660 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  26.95 
 
 
638 aa  163  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.76 
 
 
643 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  27.79 
 
 
700 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  27.12 
 
 
670 aa  157  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.76 
 
 
645 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  28.52 
 
 
545 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  27.65 
 
 
544 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  26.09 
 
 
637 aa  151  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.98 
 
 
558 aa  148  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.27 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  25.08 
 
 
627 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  30.04 
 
 
499 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  28.12 
 
 
529 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  27.29 
 
 
560 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  27.99 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  22.84 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  26.59 
 
 
628 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.5 
 
 
673 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.94 
 
 
570 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  26.38 
 
 
667 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  24.46 
 
 
670 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.3 
 
 
670 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  24.06 
 
 
667 aa  120  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  23.49 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  24.21 
 
 
524 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  26.11 
 
 
615 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  26.48 
 
 
677 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.15 
 
 
629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.61 
 
 
673 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.19 
 
 
665 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.07 
 
 
605 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  24.51 
 
 
679 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  25.23 
 
 
667 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.61 
 
 
666 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.53 
 
 
576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  25.51 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  23.6 
 
 
525 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.6 
 
 
534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.34 
 
 
690 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25.39 
 
 
644 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  23.27 
 
 
526 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.93 
 
 
626 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.93 
 
 
626 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  22.9 
 
 
618 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.5 
 
 
645 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  23.41 
 
 
663 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  26.68 
 
 
531 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.45 
 
 
599 aa  104  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  23.41 
 
 
678 aa  104  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.32 
 
 
598 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.61 
 
 
582 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6263  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.89 
 
 
193 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>