153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1123 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  100 
 
 		 678 aa  1373    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  57.55 
 
 		 655 aa  751    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  42.07 
 
 		 679 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  37.98 
 
 		 686 aa  422  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  28.55 
 
 		 673 aa  216  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  29.18 
 
 		 668 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  29.37 
 
 		 668 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.9 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  27.02 
 
 		 595 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  27.76 
 
 		 560 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  23.89 
 
 		 670 aa  127  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.58 
 
 		 670 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.76 
 
 		 595 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  26.81 
 
 		 714 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.77 
 
 		 594 aa  123  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.72 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  25.43 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  25.24 
 
 		 598 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  29.23 
 
 		 674 aa  119  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  27.09 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  27.24 
 
 		 680 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  27.1 
 
 		 674 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  24.83 
 
 		 679 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.17 
 
 		 677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  24.29 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.83 
 
 		 625 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 645 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  24.58 
 
 		 677 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  23.46 
 
 		 673 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25 
 
 		 644 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  26.88 
 
 		 705 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.2 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.32 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.8 
 
 		 561 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  25.46 
 
 		 599 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.93 
 
 		 626 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.93 
 
 		 626 aa  103  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.44 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.93 
 
 		 690 aa  103  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  24.81 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  24.88 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.77 
 
 		 605 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.77 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.77 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  25.49 
 
 		 650 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.8 
 
 		 611 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  24.31 
 
 		 608 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  27.14 
 
 		 667 aa  97.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.12 
 
 		 534 aa  96.3  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  26.46 
 
 		 667 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.25 
 
 		 677 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25 
 
 		 625 aa  95.1  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.91 
 
 		 550 aa  94.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.71 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.55 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  26.56 
 
 		 667 aa  91.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  22.81 
 
 		 542 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  26 
 
 		 668 aa  91.3  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  22.37 
 
 		 581 aa  90.9  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.29 
 
 		 545 aa  90.9  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  25.61 
 
 		 576 aa  90.5  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  24.3 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  26.07 
 
 		 670 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  24.95 
 
 		 636 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.68 
 
 		 677 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  25.62 
 
 		 670 aa  88.2  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.93 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  23.99 
 
 		 665 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0281  hypothetical protein  30.91 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.99 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  23.85 
 
 		 612 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.12 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  26.84 
 
 		 704 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  22.82 
 
 		 571 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  26.49 
 
 		 745 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23 
 
 		 588 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  21.99 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  25.68 
 
 		 615 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.68 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  24.32 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  25.36 
 
 		 667 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.24 
 
 		 647 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  28.57 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  26.18 
 
 		 667 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.37 
 
 		 558 aa  75.1  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.71 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.54 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  29.33 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  23.13 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.74 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.13 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.44 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  28.08 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.56 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.09 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  24.91 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  40.43 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.403131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>