176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2383 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  100 
 
 
571 aa  1154    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  45.38 
 
 
594 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  43.62 
 
 
595 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  45.25 
 
 
576 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  36.59 
 
 
542 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.47 
 
 
595 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  44.29 
 
 
550 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  35.78 
 
 
540 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  37.89 
 
 
553 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  34.87 
 
 
541 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  34.87 
 
 
541 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  33.57 
 
 
547 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  36.33 
 
 
588 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  37.9 
 
 
587 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.52 
 
 
577 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  38.66 
 
 
557 aa  307  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  36.69 
 
 
558 aa  296  8e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.38 
 
 
524 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  38.26 
 
 
547 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  38.19 
 
 
550 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  38.26 
 
 
548 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.76 
 
 
625 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.53 
 
 
580 aa  256  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.35 
 
 
611 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.15 
 
 
561 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.65 
 
 
647 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.63 
 
 
529 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.49 
 
 
568 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.63 
 
 
545 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.93 
 
 
550 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.03 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  28.84 
 
 
653 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.06 
 
 
542 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  32.16 
 
 
571 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  29.47 
 
 
673 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  27.95 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  33.33 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.91 
 
 
534 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  29.95 
 
 
531 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06411  acyl esterase  31.61 
 
 
525 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.741059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0021  alpha/beta fold family hydrolase  31.61 
 
 
525 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  26.48 
 
 
625 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  26.72 
 
 
641 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  25.88 
 
 
617 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  29.94 
 
 
700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  31.67 
 
 
549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  26.98 
 
 
630 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  30.33 
 
 
551 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  30.33 
 
 
551 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  30.33 
 
 
551 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  28.52 
 
 
558 aa  176  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  27.02 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  30.04 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  25.76 
 
 
524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  26.34 
 
 
526 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.92 
 
 
643 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  29.27 
 
 
537 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.65 
 
 
645 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  28.05 
 
 
670 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.77 
 
 
534 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  29.31 
 
 
679 aa  166  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  31.31 
 
 
677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  25.71 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  28.41 
 
 
627 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  29.78 
 
 
677 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.93 
 
 
585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  28.31 
 
 
670 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1020  acyl esterase  30.38 
 
 
534 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.23 
 
 
673 aa  163  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  28.04 
 
 
637 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  30.02 
 
 
680 aa  161  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  28.95 
 
 
670 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  27.13 
 
 
660 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.3 
 
 
629 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  29.18 
 
 
677 aa  160  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  29.7 
 
 
678 aa  160  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  27.42 
 
 
637 aa  159  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  28.52 
 
 
677 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.97 
 
 
663 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  30.87 
 
 
667 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  29.07 
 
 
674 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.41 
 
 
641 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  30.2 
 
 
556 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  30.11 
 
 
545 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  30.62 
 
 
690 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  29.44 
 
 
667 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  29.38 
 
 
668 aa  153  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  27.79 
 
 
667 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  28.7 
 
 
674 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  30.07 
 
 
650 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  30.52 
 
 
665 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  28.11 
 
 
667 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  26.49 
 
 
668 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  26.32 
 
 
663 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  25 
 
 
618 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  28.11 
 
 
667 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  28.55 
 
 
544 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.75 
 
 
666 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  26.52 
 
 
714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10661  hypothetical protein  43.67 
 
 
172 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.707994  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>