164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3127 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  100 
 
 
571 aa  1123    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  88.56 
 
 
546 aa  937    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  51.19 
 
 
550 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  49.56 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  48.83 
 
 
561 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  47.63 
 
 
545 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  47 
 
 
529 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  45.17 
 
 
580 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  44.81 
 
 
542 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  41.49 
 
 
534 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  43 
 
 
549 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  42.11 
 
 
551 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  42.11 
 
 
551 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  42.11 
 
 
551 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  41.62 
 
 
545 aa  326  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  42.23 
 
 
544 aa  316  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  38.15 
 
 
529 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  31.27 
 
 
547 aa  259  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.51 
 
 
588 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.3 
 
 
595 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  33.79 
 
 
595 aa  239  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.11 
 
 
524 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.45 
 
 
577 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  33.81 
 
 
557 aa  220  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.38 
 
 
594 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  33.97 
 
 
576 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  32.75 
 
 
571 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.57 
 
 
550 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.4 
 
 
587 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  28.16 
 
 
542 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  26.82 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  26.63 
 
 
541 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  25.78 
 
 
540 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.47 
 
 
625 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.03 
 
 
647 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  27.91 
 
 
553 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  29.48 
 
 
558 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  33.46 
 
 
499 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.79 
 
 
653 aa  153  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  30.37 
 
 
537 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  29.14 
 
 
537 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  26.44 
 
 
558 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.41 
 
 
611 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  30.87 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  31.51 
 
 
550 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  26.61 
 
 
668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  25.55 
 
 
641 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  30.67 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  31.08 
 
 
548 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  26.37 
 
 
668 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  24.96 
 
 
625 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  25.88 
 
 
700 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  25.73 
 
 
638 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.19 
 
 
670 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  28.72 
 
 
667 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  24.11 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  27.22 
 
 
678 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  21.87 
 
 
574 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.42 
 
 
670 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.74 
 
 
629 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  27.44 
 
 
677 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  26.67 
 
 
637 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0021  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
525 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  26.72 
 
 
677 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.32 
 
 
585 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.46 
 
 
679 aa  106  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06411  acyl esterase  25.64 
 
 
525 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.741059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  23.66 
 
 
630 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.57 
 
 
643 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  22.44 
 
 
526 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  26.47 
 
 
668 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.2 
 
 
673 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  26.14 
 
 
677 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  26.67 
 
 
704 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  27 
 
 
615 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  26.4 
 
 
670 aa  99  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  26.62 
 
 
690 aa  97.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  26.12 
 
 
677 aa  97.1  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  27.92 
 
 
674 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  26.84 
 
 
690 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  26.43 
 
 
555 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  26.02 
 
 
686 aa  94.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  26.27 
 
 
641 aa  94.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.74 
 
 
645 aa  94  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.67 
 
 
663 aa  94  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  25.86 
 
 
628 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  22.64 
 
 
526 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  23.67 
 
 
660 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  22.11 
 
 
525 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.95 
 
 
714 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  22.16 
 
 
663 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.48 
 
 
674 aa  91.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  24.61 
 
 
531 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  22.54 
 
 
524 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.01 
 
 
576 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.52 
 
 
673 aa  89.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  26.69 
 
 
547 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.82 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.82 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.32 
 
 
645 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>