187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2454 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  100 
 
 
595 aa  1240    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  40.11 
 
 
547 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  39.79 
 
 
594 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  39.47 
 
 
571 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  37.46 
 
 
588 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  40.07 
 
 
550 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  37.33 
 
 
595 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  40.03 
 
 
576 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  36.49 
 
 
587 aa  343  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  38.34 
 
 
577 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.86 
 
 
647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  34.37 
 
 
625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  35.38 
 
 
557 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.87 
 
 
580 aa  293  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.87 
 
 
545 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32 
 
 
524 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.42 
 
 
550 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.74 
 
 
561 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.38 
 
 
529 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  31.02 
 
 
540 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  31.49 
 
 
541 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  31.32 
 
 
541 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  30.89 
 
 
542 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.03 
 
 
542 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  29.33 
 
 
553 aa  240  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.18 
 
 
546 aa  239  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.47 
 
 
534 aa  237  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.61 
 
 
611 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.78 
 
 
568 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  30.19 
 
 
571 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  29.93 
 
 
558 aa  223  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  30.48 
 
 
653 aa  223  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  29.92 
 
 
617 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  30.46 
 
 
550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  29.18 
 
 
547 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  29.24 
 
 
630 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  31.28 
 
 
638 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  31.96 
 
 
549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  30.77 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  29.55 
 
 
548 aa  207  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  29.8 
 
 
625 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  32.66 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.32 
 
 
629 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  30.68 
 
 
537 aa  200  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  30.47 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  30.47 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  30.47 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  29 
 
 
700 aa  196  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.35 
 
 
645 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  30.52 
 
 
637 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  27.88 
 
 
641 aa  193  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.26 
 
 
663 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  29.15 
 
 
660 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  29.03 
 
 
637 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.71 
 
 
643 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  30.46 
 
 
670 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  31.36 
 
 
545 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  27.67 
 
 
537 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  29.21 
 
 
544 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  29.34 
 
 
627 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  28.08 
 
 
663 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.44 
 
 
641 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  27.89 
 
 
618 aa  174  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.21 
 
 
666 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  27.77 
 
 
670 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  28.36 
 
 
673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  27.21 
 
 
668 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  28.33 
 
 
667 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  27.31 
 
 
670 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  26.91 
 
 
668 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  28.47 
 
 
556 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.57 
 
 
585 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  26.23 
 
 
529 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  27.27 
 
 
677 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  26.64 
 
 
650 aa  147  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25.55 
 
 
668 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.22 
 
 
679 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  27.21 
 
 
677 aa  144  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.96 
 
 
534 aa  143  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.34 
 
 
677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  26.99 
 
 
680 aa  141  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.33 
 
 
673 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  24.76 
 
 
686 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  26.16 
 
 
679 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  26.22 
 
 
560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.78 
 
 
714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  25.83 
 
 
690 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  24.95 
 
 
674 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  25.47 
 
 
626 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.47 
 
 
626 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  25.28 
 
 
670 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.72 
 
 
668 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  24.91 
 
 
677 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  25.27 
 
 
667 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.47 
 
 
645 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  26.35 
 
 
612 aa  130  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.82 
 
 
690 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.49 
 
 
570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.85 
 
 
561 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  25.37 
 
 
670 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>