139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3228 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  100 
 
 		 627 aa  1273    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  53.86 
 
 		 643 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  59.84 
 
 		 637 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  55.12 
 
 		 660 aa  701    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  58.89 
 
 		 641 aa  710    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  54.73 
 
 		 663 aa  702    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  57.75 
 
 		 637 aa  729    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  58.18 
 
 		 645 aa  731    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  56.38 
 
 		 670 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  38.14 
 
 		 630 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  37.32 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  36.6 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  37.6 
 
 		 638 aa  357  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  37.38 
 
 		 700 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.38 
 
 		 629 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  33.39 
 
 		 641 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.77 
 
 		 666 aa  313  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  34.16 
 
 		 618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  31.03 
 
 		 576 aa  187  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.34 
 
 		 595 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  28.79 
 
 		 547 aa  170  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  28.73 
 
 		 571 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.25 
 
 		 594 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.03 
 
 		 588 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.9 
 
 		 625 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  29.8 
 
 		 557 aa  150  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.22 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.48 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.44 
 
 		 647 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.08 
 
 		 587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.61 
 
 		 611 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.48 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.55 
 
 		 553 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.73 
 
 		 653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  24.9 
 
 		 542 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.9 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.93 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  23.69 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25 
 
 		 668 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  26.33 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  25.1 
 
 		 541 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.71 
 
 		 550 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  25.1 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.82 
 
 		 561 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  25.27 
 
 		 665 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  25.04 
 
 		 678 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.51 
 
 		 650 aa  98.2  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.01 
 
 		 670 aa  96.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  27.26 
 
 		 547 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  26.7 
 
 		 549 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  23.03 
 
 		 670 aa  91.3  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  23.55 
 
 		 677 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  24.09 
 
 		 677 aa  89.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  25.96 
 
 		 537 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.1 
 
 		 558 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  31.49 
 
 		 595 aa  88.6  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  25.49 
 
 		 690 aa  87.8  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  26.44 
 
 		 548 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  23.23 
 
 		 667 aa  87.4  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  26.5 
 
 		 550 aa  87  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.12 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  23.88 
 
 		 667 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.22 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  29.04 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  23.78 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  26.03 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.13 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  25.27 
 
 		 674 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.14 
 
 		 580 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.58 
 
 		 667 aa  82  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  24.08 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  35.86 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  23.92 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  24.16 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  26.25 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  23.69 
 
 		 714 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.73 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.87 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.58 
 
 		 674 aa  76.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.41 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.01 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  24.87 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  24.87 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  24.87 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  23.66 
 
 		 677 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.53 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  21.35 
 
 		 711 aa  70.5  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  23.04 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  23.62 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  25.93 
 
 		 558 aa  69.3  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  24.49 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  24.51 
 
 		 644 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  27.42 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  31.71 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.32 
 
 		 605 aa  63.9  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  31.62 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.06 
 
 		 576 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  24.4 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  29.7 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>