145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1711 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  100 
 
 
548 aa  1059    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  92.73 
 
 
550 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  95.62 
 
 
547 aa  990    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  40.36 
 
 
542 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  40.4 
 
 
541 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  40.22 
 
 
541 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  39.02 
 
 
540 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  40.96 
 
 
553 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  40.64 
 
 
558 aa  329  7e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  38.26 
 
 
571 aa  277  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  35.59 
 
 
531 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  35.92 
 
 
547 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.1 
 
 
594 aa  247  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06501  acyl esterase  30.93 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06411  acyl esterase  34.71 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.741059 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  31.24 
 
 
526 aa  243  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0021  alpha/beta fold family hydrolase  34.44 
 
 
525 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  30.87 
 
 
524 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1020  acyl esterase  37.43 
 
 
534 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  30.3 
 
 
526 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  38.88 
 
 
576 aa  226  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.86 
 
 
595 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.6 
 
 
524 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.99 
 
 
550 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  27.07 
 
 
547 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.56 
 
 
550 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.61 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  33.08 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  32.92 
 
 
557 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.17 
 
 
577 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  32.28 
 
 
551 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  32.28 
 
 
551 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  32.28 
 
 
551 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.95 
 
 
588 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.61 
 
 
545 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  32.25 
 
 
545 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.39 
 
 
529 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.22 
 
 
534 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.33 
 
 
625 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.42 
 
 
561 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.51 
 
 
542 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  33.86 
 
 
499 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  30.27 
 
 
544 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  30.6 
 
 
549 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.96 
 
 
580 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10661  hypothetical protein  47.34 
 
 
172 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.707994  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.77 
 
 
568 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.27 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  29.96 
 
 
537 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  29.04 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.02 
 
 
611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  30.81 
 
 
595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.16 
 
 
647 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10671  hypothetical protein  27.07 
 
 
380 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43083  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  31.03 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.27 
 
 
653 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  30.42 
 
 
571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.08 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  25.95 
 
 
637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  25.09 
 
 
670 aa  105  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  25.18 
 
 
558 aa  103  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  23.23 
 
 
617 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.55 
 
 
668 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  27.65 
 
 
673 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.9 
 
 
599 aa  96.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  26.86 
 
 
615 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  25.9 
 
 
641 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  25.45 
 
 
637 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  25.78 
 
 
638 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.92 
 
 
643 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  27.01 
 
 
627 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.38 
 
 
585 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  24.79 
 
 
660 aa  91.3  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.18 
 
 
663 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.04 
 
 
645 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  23.41 
 
 
630 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  25.52 
 
 
625 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  26.22 
 
 
690 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.87 
 
 
668 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  22.89 
 
 
618 aa  87.4  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.81 
 
 
570 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  26.33 
 
 
644 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  27.12 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  27.07 
 
 
677 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.82 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  24.78 
 
 
677 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.87 
 
 
668 aa  80.5  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25.28 
 
 
668 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.64 
 
 
674 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  24.81 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  27.12 
 
 
650 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  25.19 
 
 
667 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  25.38 
 
 
667 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  25 
 
 
674 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  25.08 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  22.35 
 
 
663 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.81 
 
 
666 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  26.79 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.52 
 
 
534 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  21.04 
 
 
670 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>