281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0391 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  100 
 
 		 668 aa  1373    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  42.34 
 
 		 690 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  41.9 
 
 		 670 aa  510  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  41.74 
 
 		 668 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  40.36 
 
 		 663 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  42.71 
 
 		 677 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  42.71 
 
 		 678 aa  502  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  42.46 
 
 		 677 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  42.56 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  44.05 
 
 		 690 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  41.78 
 
 		 677 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  41 
 
 		 667 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  40.38 
 
 		 673 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  39.73 
 
 		 670 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  40.74 
 
 		 667 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  40.86 
 
 		 674 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  41.52 
 
 		 665 aa  475  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  40.84 
 
 		 674 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  40.64 
 
 		 679 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  40.94 
 
 		 650 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  40.89 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  41.06 
 
 		 677 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  39.49 
 
 		 667 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  34.58 
 
 		 670 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  34.77 
 
 		 670 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  39.01 
 
 		 667 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  38.86 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  34.39 
 
 		 711 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  35.51 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  32.17 
 
 		 705 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0269  peptidase S15  37.96 
 
 		 745 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485084  normal  0.582003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.56 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  29.38 
 
 		 571 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.39 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.6 
 
 		 550 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.41 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.66 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.47 
 
 		 553 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.19 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.72 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  24.48 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.33 
 
 		 647 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  27.83 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.95 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  25.59 
 
 		 668 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.02 
 
 		 611 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  24.19 
 
 		 547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  25.38 
 
 		 555 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  25.59 
 
 		 668 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  25 
 
 		 541 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  25.19 
 
 		 541 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  27.81 
 
 		 595 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.4 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.79 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.57 
 
 		 550 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  26.36 
 
 		 615 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  26.33 
 
 		 612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  24.1 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.21 
 
 		 570 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.75 
 
 		 580 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  25.79 
 
 		 644 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  28.36 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  22.17 
 
 		 641 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  25.46 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.42 
 
 		 611 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  26.48 
 
 		 545 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  21.94 
 
 		 630 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  25.34 
 
 		 673 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  26.49 
 
 		 499 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.25 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  27.85 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.91 
 
 		 576 aa  99.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  23.8 
 
 		 549 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  25.14 
 
 		 529 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  30.03 
 
 		 503 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.01 
 
 		 587 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  26.15 
 
 		 558 aa  94.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.41 
 
 		 598 aa  94  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 609 aa  92  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.61 
 
 		 629 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  23.82 
 
 		 584 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.87 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.93 
 
 		 599 aa  88.6  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  21.47 
 
 		 625 aa  88.6  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  24.12 
 
 		 700 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.05 
 
 		 560 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  23.05 
 
 		 547 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  24.37 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  24.37 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.32 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  39.16 
 
 		 763 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  24.37 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  23.64 
 
 		 686 aa  85.5  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0921  acyl esterase  23.87 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  22.18 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  22.36 
 
 		 574 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  26.01 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  23.74 
 
 		 569 aa  84  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  24.17 
 
 		 641 aa  83.2  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3229  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  24.89 
 
 		 656 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>