136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1460 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1460  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  100 
 
 
607 aa  1208    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27540  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  62.92 
 
 
584 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1938  hydrolase CocE/NonD family protein  46.76 
 
 
644 aa  514  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2891  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  46.21 
 
 
597 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.024928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2667  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.49 
 
 
597 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.300273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2588  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.66 
 
 
597 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2860  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.49 
 
 
597 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2664  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  46.13 
 
 
574 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2908  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.94 
 
 
597 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3908  Xaa-Pro dipeptidyl-peptidase  45.57 
 
 
667 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.135659  normal  0.218311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2865  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.49 
 
 
597 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2618  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.66 
 
 
579 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2873  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  45.31 
 
 
579 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3229  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  42.06 
 
 
656 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5138  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  42.06 
 
 
656 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5144  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  42.29 
 
 
656 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0505  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  41.61 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4532  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  42.05 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5057  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  42.22 
 
 
651 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1100  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  41.69 
 
 
714 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0380  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  41.03 
 
 
725 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.871447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2859  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  41.69 
 
 
644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2707  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  41.69 
 
 
644 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07600  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  38.29 
 
 
609 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2369  Xaa-pro dipeptidyl-peptidase (x-pro dipeptidyl-peptidase) (x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase) (x-pdap)  51.85 
 
 
345 aa  336  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.704723  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1647  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  30.56 
 
 
800 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0506  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  30.87 
 
 
776 aa  264  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0712  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.73 
 
 
794 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1736  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  28.91 
 
 
761 aa  260  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00688929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1411  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  28.96 
 
 
795 aa  260  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1633  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  30.24 
 
 
755 aa  251  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2342  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  37.17 
 
 
763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0882  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.49 
 
 
578 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2222  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.49 
 
 
654 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0212036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0065  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.49 
 
 
578 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.773061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1555  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.49 
 
 
578 aa  218  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0974  x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  29.49 
 
 
654 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2421  X-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase  35.35 
 
 
211 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.336185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.46 
 
 
668 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  27.65 
 
 
673 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.51 
 
 
677 aa  95.1  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  23.52 
 
 
677 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.35 
 
 
714 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  24.49 
 
 
678 aa  88.6  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  26.29 
 
 
674 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  23.6 
 
 
615 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  25.41 
 
 
569 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.49 
 
 
550 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  23.97 
 
 
670 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  21.62 
 
 
663 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  22.27 
 
 
674 aa  78.2  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  23.82 
 
 
667 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  24.41 
 
 
598 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25 
 
 
677 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  24.24 
 
 
680 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  22.22 
 
 
668 aa  74.3  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  24.3 
 
 
679 aa  73.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  24.57 
 
 
532 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  23.63 
 
 
555 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  33.09 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  24.25 
 
 
704 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  24.35 
 
 
667 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  23.14 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  25.2 
 
 
665 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.59 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  23.87 
 
 
677 aa  71.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  22.59 
 
 
670 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  26.3 
 
 
599 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  23.37 
 
 
667 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  23.71 
 
 
690 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.19 
 
 
611 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  23.62 
 
 
612 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.93 
 
 
545 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.74 
 
 
609 aa  65.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.28 
 
 
599 aa  65.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.58 
 
 
604 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.8 
 
 
568 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.53 
 
 
625 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.86 
 
 
611 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  33.52 
 
 
556 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  28.84 
 
 
571 aa  60.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.05 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.44 
 
 
576 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  20.48 
 
 
557 aa  58.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  28.69 
 
 
497 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.27 
 
 
572 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00440  putative hydrolase, CocE/NonD family  22.51 
 
 
637 aa  56.2  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.403131 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  27.67 
 
 
567 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  27.67 
 
 
572 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.02 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  27.67 
 
 
572 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  22.41 
 
 
705 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.7 
 
 
587 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  23.86 
 
 
560 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  31.25 
 
 
793 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  21.34 
 
 
690 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.48 
 
 
546 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.57 
 
 
561 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  20.72 
 
 
630 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.97 
 
 
605 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>