156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1297 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1297  acylase and diesterase protein  100 
 
 
608 aa  1249    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.36424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11190  putative hydrolase, CocE/NonD family  41.71 
 
 
581 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290865  normal  0.803564 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  40.1 
 
 
588 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  38.22 
 
 
560 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  38.22 
 
 
560 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  40.87 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08476  conserved hypothetical protein  37.46 
 
 
591 aa  333  5e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.706032  normal  0.916636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  35.13 
 
 
561 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  30.9 
 
 
569 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  32.62 
 
 
560 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  32.48 
 
 
598 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  32.12 
 
 
599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  31.97 
 
 
599 aa  232  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  29.25 
 
 
793 aa  170  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.92 
 
 
604 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.91 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.04 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.92 
 
 
595 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.9 
 
 
609 aa  107  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.06 
 
 
673 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  23.4 
 
 
679 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.31 
 
 
678 aa  100  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  32.1 
 
 
534 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.73 
 
 
611 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  32.29 
 
 
595 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  26.51 
 
 
670 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.52 
 
 
553 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  36.81 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  26.3 
 
 
668 aa  94  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  26.3 
 
 
668 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  30.68 
 
 
540 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  26.52 
 
 
670 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.71 
 
 
577 aa  91.3  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  31.58 
 
 
542 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.51 
 
 
594 aa  90.1  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  22.16 
 
 
547 aa  88.6  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  25 
 
 
655 aa  89  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  27.25 
 
 
571 aa  86.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  23.63 
 
 
644 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.81 
 
 
677 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.51 
 
 
647 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  24.46 
 
 
674 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  25.54 
 
 
670 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  28.4 
 
 
555 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  32.02 
 
 
612 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  32.95 
 
 
673 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  21.25 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.29 
 
 
550 aa  80.9  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.09 
 
 
625 aa  80.9  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  33.15 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  25.23 
 
 
670 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  26.63 
 
 
663 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  25.85 
 
 
677 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  24.78 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  25.78 
 
 
677 aa  77.4  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.99 
 
 
714 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  26.15 
 
 
690 aa  75.5  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  27.17 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  23.19 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  24.45 
 
 
668 aa  75.5  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.58 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.91 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  23.91 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.2 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  25.6 
 
 
677 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  29.34 
 
 
705 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  22.67 
 
 
667 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  26.34 
 
 
763 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  25.3 
 
 
678 aa  71.6  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  22.82 
 
 
558 aa  70.1  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0281  hypothetical protein  30.94 
 
 
198 aa  69.7  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.02 
 
 
665 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  31.98 
 
 
615 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  22.26 
 
 
667 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  23.22 
 
 
667 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.52 
 
 
611 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  23.65 
 
 
680 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  26.97 
 
 
537 aa  67.8  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  23.22 
 
 
667 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.1 
 
 
580 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  24.72 
 
 
557 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.81 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.67 
 
 
588 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  33.33 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.28 
 
 
625 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.35 
 
 
570 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.18 
 
 
561 aa  65.1  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  26.63 
 
 
503 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  22.78 
 
 
674 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  23.64 
 
 
711 aa  63.9  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  28.4 
 
 
690 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  27.54 
 
 
547 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  31.11 
 
 
524 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  26.51 
 
 
576 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  25.47 
 
 
667 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  29.61 
 
 
628 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06411  acyl esterase  30.37 
 
 
526 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.922667  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.89 
 
 
645 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0585  hypothetical protein  29.63 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.364803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.22 
 
 
650 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>