179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3343 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  100 
 
 		 636 aa  1318    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  33.06 
 
 		 605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  34.03 
 
 		 628 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.68 
 
 		 645 aa  302  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  32.74 
 
 		 626 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 626 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  31.38 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  31.48 
 
 		 615 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  31.53 
 
 		 612 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  31.03 
 
 		 644 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.4 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  23.76 
 
 		 668 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.05 
 
 		 577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  23.45 
 
 		 793 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  21.95 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  24.39 
 
 		 595 aa  114  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.54 
 
 		 588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.56 
 
 		 599 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.61 
 
 		 550 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.97 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.97 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  22.36 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.41 
 
 		 673 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  24.33 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  22.85 
 
 		 569 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.23 
 
 		 629 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  22.53 
 
 		 670 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  22.86 
 
 		 638 aa  104  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  23.53 
 
 		 677 aa  104  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  24.52 
 
 		 542 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  23.22 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  23.21 
 
 		 714 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.61 
 
 		 611 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  23.22 
 
 		 541 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  23.14 
 
 		 678 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.94 
 
 		 547 aa  99  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  22.22 
 
 		 667 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  21.46 
 
 		 641 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  22.99 
 
 		 617 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  21.7 
 
 		 677 aa  97.8  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  22.31 
 
 		 540 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.09 
 
 		 587 aa  97.4  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  22.93 
 
 		 668 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  22.94 
 
 		 680 aa  94.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.72 
 
 		 594 aa  90.1  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.95 
 
 		 678 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  23.5 
 
 		 674 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  23.81 
 
 		 571 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.54 
 
 		 524 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  23.12 
 
 		 576 aa  87.8  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.4 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  21.5 
 
 		 667 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  20.69 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.4 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  21.91 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  23.39 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  23.33 
 
 		 763 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  22.39 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  22.83 
 
 		 553 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  34.21 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.54 
 
 		 625 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  32.26 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  23.97 
 
 		 668 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  20.52 
 
 		 625 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  21.65 
 
 		 674 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  21.25 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.54 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  21.62 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  21.21 
 
 		 670 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  21.77 
 
 		 609 aa  78.2  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  22.66 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  21.57 
 
 		 670 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0574  peptidase S15  34.21 
 
 		 556 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  20.71 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.08 
 
 		 561 aa  75.1  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  21.64 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  23.24 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  29.47 
 
 		 599 aa  74.3  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  33.33 
 
 		 650 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  30.3 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  32.43 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 643 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  29.14 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  29.14 
 
 		 679 aa  71.2  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11239  hypothetical protein  31.47 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000144699  normal  0.0575196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  20.74 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  29.37 
 
 		 673 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  20.95 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.02 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28231  predicted protein  41.33 
 
 		 711 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  20.27 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.81 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.67 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4602  peptidase S15  23.42 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.712555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  30.81 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  42.53 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  30.26 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  20.48 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  29.68 
 
 		 704 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  25.26 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>