53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1959 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  100 
 
 
318 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.96 
 
 
292 aa  305  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  56.84 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  53.68 
 
 
304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.86 
 
 
285 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  42.91 
 
 
304 aa  229  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.29 
 
 
288 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
280 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.2 
 
 
262 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
264 aa  92.4  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  26.28 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  47 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  35.92 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  31.82 
 
 
638 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  31.36 
 
 
638 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.23 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  24.35 
 
 
615 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  30.15 
 
 
597 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  36.8 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.67 
 
 
255 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  26.69 
 
 
636 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0307  hypothetical protein  37.31 
 
 
111 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  24.54 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  28.7 
 
 
592 aa  49.7  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  28.14 
 
 
614 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4173  hypothetical protein  31.76 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0253164  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  32.03 
 
 
618 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  32.03 
 
 
618 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.66 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  23.49 
 
 
585 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  34.38 
 
 
317 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 
634 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  32.97 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  31.03 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  29.57 
 
 
631 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  36.73 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  28.17 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1319  hypothetical protein  29.05 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.668778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3188  hypothetical protein  34.58 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0478  hypothetical protein  26.77 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.218864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  39.74 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  37.17 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14054  predicted protein  30.49 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  33.56 
 
 
592 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  30.37 
 
 
462 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  30.16 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  26.67 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  32.33 
 
 
259 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.58 
 
 
258 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>