14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1934 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1934  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2342  esterase/lipase/thioesterase family protein  53.18 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  42.69 
 
 		 280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.92 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.19 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.45 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.37 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  33.2 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.47 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.57 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0305  hypothetical protein  33.96 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  40.86 
 
 		 615 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  32.95 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  30.83 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>