65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5845 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1229    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  35.53 
 
 		 614 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  36.42 
 
 		 634 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  34.77 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  34.41 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  33.6 
 
 		 618 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.83 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  33.49 
 
 		 658 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  33.49 
 
 		 658 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  33.49 
 
 		 658 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  34.62 
 
 		 707 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  32.25 
 
 		 605 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1533 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  33.64 
 
 		 662 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  32.74 
 
 		 636 aa  227  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  32.24 
 
 		 608 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  32.29 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  32.45 
 
 		 592 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  29.66 
 
 		 595 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  29.66 
 
 		 595 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  24.28 
 
 		 585 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  29.34 
 
 		 636 aa  163  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  28.01 
 
 		 1103 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 1103 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  26.72 
 
 		 638 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  27.3 
 
 		 638 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  23.85 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  43.07 
 
 		 272 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  26.57 
 
 		 588 aa  87  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  44.7 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  43.09 
 
 		 893 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  26.98 
 
 		 596 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  32.18 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.27 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2366  hypothetical protein  27.41 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.4 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1959  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.35 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.175259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1570  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.14 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.329769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2523  hydrolase, exosortase system type 1 associated  26.35 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0221789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.14 
 
 		 292 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0694  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.65 
 
 		 288 aa  54.7  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 374 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 297 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.12 
 
 		 313 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  34.34 
 
 		 292 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 306 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  28.81 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  35 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3124  Alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 280 aa  48.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  32.17 
 
 		 259 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  28.28 
 
 		 400 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  30.86 
 
 		 308 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  29.1 
 
 		 325 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  26.83 
 
 		 287 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 287 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 		 356 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 287 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 273 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 		 255 aa  44.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  33.58 
 
 		 311 aa  43.9  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 295 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36.36 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 295 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>