176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3055 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  49.6 
 
 
413 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  51.01 
 
 
412 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  51.39 
 
 
423 aa  249  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  44.44 
 
 
405 aa  245  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  51 
 
 
409 aa  240  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  49.8 
 
 
402 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  52.99 
 
 
409 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  49.8 
 
 
410 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  46.25 
 
 
258 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  47.22 
 
 
408 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  53.39 
 
 
406 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.79 
 
 
405 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  51 
 
 
405 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  47.76 
 
 
415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  49.8 
 
 
406 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  51.22 
 
 
406 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  45.23 
 
 
251 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  50.59 
 
 
407 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  50.2 
 
 
406 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  46.94 
 
 
257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  46.09 
 
 
257 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  47.62 
 
 
410 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  51.39 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  46.43 
 
 
397 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  46.43 
 
 
410 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  45.16 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  52.38 
 
 
408 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  42.97 
 
 
256 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  51.98 
 
 
408 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  45.16 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  44.1 
 
 
256 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  43.95 
 
 
250 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  39.04 
 
 
259 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  47.41 
 
 
259 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  43.9 
 
 
256 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  47.9 
 
 
418 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  49.66 
 
 
145 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  38.1 
 
 
411 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  27 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  28.4 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.81 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.09 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.36 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.53 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.15 
 
 
645 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  23.41 
 
 
281 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.59 
 
 
645 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.77 
 
 
645 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 
645 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.1 
 
 
645 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  28.06 
 
 
336 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  25.87 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  24.88 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  31.54 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  35.46 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.71 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  27.78 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  22.61 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
256 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  26.23 
 
 
279 aa  53.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  33.1 
 
 
580 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  23.59 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  26.73 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.6 
 
 
294 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.17 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.5 
 
 
645 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.41 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.17 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.17 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  26.06 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.17 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.17 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  29.84 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.82 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.26 
 
 
644 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  34.75 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 
634 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  33.58 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  23.44 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.77 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  21.74 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  37.93 
 
 
380 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  23.83 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4813  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  32.12 
 
 
305 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  32.12 
 
 
305 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.85 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.85 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.85 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  21.74 
 
 
284 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>