73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2224 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  73.36 
 
 		 244 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  58.36 
 
 		 271 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  59.34 
 
 		 248 aa  298  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  54.55 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  58.2 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  54.13 
 
 		 256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  54.13 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  53.31 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  55.2 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  54.96 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  54 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  55.28 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  55.51 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  56.85 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  49.38 
 
 		 242 aa  248  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  52.3 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  52.3 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.2 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.21 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.48 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.54 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  24.58 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.56 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  32.17 
 
 		 638 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.11 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28 
 
 		 652 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  28.06 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.65 
 
 		 653 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  27.27 
 
 		 246 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  32.14 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  28.8 
 
 		 678 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  29.46 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  28.48 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.73 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  28.45 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  31.07 
 
 		 1010 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  23.87 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  27.42 
 
 		 657 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  34.58 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  28.74 
 
 		 501 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  30.89 
 
 		 868 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.68 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  30.21 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.2 
 
 		 688 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.82 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  29.11 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  27.1 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  24.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  28.42 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  22.5 
 
 		 263 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  29.47 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1491  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199591  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  29.11 
 
 		 274 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  32.04 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  28.3 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  26.27 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  30.1 
 
 		 968 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  26.79 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.76 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  19.09 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  26.38 
 
 		 253 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>