More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2529 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 
252 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  40.82 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  46.96 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 
259 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 
259 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 
259 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  40.64 
 
 
265 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.15 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  33.62 
 
 
250 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
280 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.16 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.8 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
256 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.79 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  27.06 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  30.51 
 
 
389 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.5 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
283 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  43.69 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  44 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  26.28 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  44 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 
392 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  34.97 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
278 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.71 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  28.64 
 
 
386 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  21.33 
 
 
300 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.02 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
331 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  34.62 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  34.62 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  34.62 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  33.33 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  29.1 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  26.29 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  24.61 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  38.18 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.08 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
285 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  32.79 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
339 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.39 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.2 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>