More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2442 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  56.41 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  33.91 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  34.91 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  38.02 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.3 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.37 
 
 		 562 aa  79.7  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.85 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  29.37 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.64 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  29.44 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  29.64 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  28.97 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  28.97 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  28.97 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  28.97 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.5 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  26.48 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  28.63 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.79 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.37 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.37 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.37 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.17 
 
 		 571 aa  65.5  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  28.51 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  28.51 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  28.51 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  28.81 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.91 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  29.15 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  28.51 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  28.51 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  24.89 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  28.51 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.84 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  28.09 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.5 
 
 		 372 aa  62  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  33.15 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.27 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.86 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.19 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  27.53 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.07 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.12 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  21.49 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  24.25 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  24.29 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.86 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.86 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.86 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  27.71 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  25.11 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  24.79 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  30.67 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  25.24 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>