More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2625 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2442  putative hydrolase  56.91 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  31.88 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22440  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.36 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  31.12 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 281 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3251  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1862  Alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4198  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.345752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4168  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3348  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.32 
 
 		 562 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 309 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  21.68 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.45 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.28 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.28 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  27.1 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.47 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.07 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  24.18 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  20.91 
 
 		 571 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.83 
 
 		 370 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  24.18 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  24.18 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.35 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  28.86 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  23.31 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  25.5 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.77 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.63 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  24.87 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  23.6 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.2 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  31.21 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  26.19 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  23.6 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  23.6 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  33.33 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.83 
 
 		 370 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.26 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  24.27 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.4 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.63 
 
 		 368 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.14 
 
 		 370 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.69 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  30.09 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 339 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  23.45 
 
 		 277 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>