103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3436 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3436  esterase  100 
 
 		 250 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3593  esterase  90.8 
 
 		 250 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.924442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3640  esterase  63.6 
 
 		 249 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0684  esterase  63.6 
 
 		 249 aa  334  5.999999999999999e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3786  esterase  63.2 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0773  esterase  64 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000177288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0793  esterase  57.83 
 
 		 250 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00954215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0444  esterase  55.38 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0369  esterase  52.99 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.0288609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3803  phospholipase/Carboxylesterase  47.62 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3823  esterase  47.22 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000203286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04057  predicted hydrolase  46.83 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4751  esterase  47.22 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04019  hypothetical protein  46.83 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4721  esterase  46.83 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5707  esterase  46.43 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4434  esterase  46.83 
 
 		 249 aa  228  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4662  esterase  47.22 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68752 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4741  esterase  46.61 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4798  esterase  47.01 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4658  esterase  46.61 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4777  esterase  46.61 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4648  esterase  46.22 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1546  hypothetical protein  37.21 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  27.19 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0192  hypothetical protein  28.8 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  25.75 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  28.19 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  26.24 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  26.12 
 
 		 645 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.05 
 
 		 615 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.42 
 
 		 682 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 		 645 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  28.5 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  25.58 
 
 		 841 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2909  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.22 
 
 		 735 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.8 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.42 
 
 		 682 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  26.24 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.42 
 
 		 682 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.42 
 
 		 682 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.83 
 
 		 645 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.83 
 
 		 645 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 		 676 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  19.76 
 
 		 641 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.7 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.1 
 
 		 638 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.7 
 
 		 280 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.61 
 
 		 750 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2009  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.83 
 
 		 677 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 		 677 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.59 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  26.84 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  33.58 
 
 		 968 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  29.08 
 
 		 689 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.83 
 
 		 677 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.27 
 
 		 644 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.48 
 
 		 300 aa  46.2  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  30.32 
 
 		 752 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.75 
 
 		 705 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.66 
 
 		 767 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0249  peptidase S15  23.38 
 
 		 339 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0965302  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.37 
 
 		 721 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.43 
 
 		 751 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13777  predicted protein  27.47 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.11 
 
 		 631 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.09 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.54 
 
 		 652 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.55 
 
 		 686 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.54 
 
 		 652 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.54 
 
 		 652 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 		 605 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2468  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.78 
 
 		 628 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 		 824 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  31.36 
 
 		 729 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.1 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  23.75 
 
 		 644 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4629  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 		 747 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  28.51 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  24.81 
 
 		 571 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  29.68 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.6 
 
 		 765 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1436  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.69 
 
 		 776 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  0.0231661 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  32.59 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.72 
 
 		 610 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  26.91 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  35.58 
 
 		 724 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  27.13 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  27.92 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 		 661 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  28.72 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  37.7 
 
 		 471 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 		 708 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>