41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1349 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  53.64 
 
 
261 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  53.1 
 
 
261 aa  291  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  51.16 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  48.85 
 
 
261 aa  278  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  43.25 
 
 
266 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  34.92 
 
 
266 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  34.77 
 
 
266 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  31.32 
 
 
269 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  30.19 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  29.55 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  33.07 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  30.42 
 
 
257 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  31.48 
 
 
166 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  25.29 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  25 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  25.1 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  24.81 
 
 
524 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  20.85 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  26.21 
 
 
386 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  18.98 
 
 
297 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  22.48 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  30.77 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  22.6 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 
270 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  23.5 
 
 
295 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>