37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2567 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  541  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  66.41 
 
 
258 aa  363  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  63.57 
 
 
261 aa  362  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  55.17 
 
 
261 aa  317  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  53.64 
 
 
258 aa  296  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  50.99 
 
 
266 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  34.78 
 
 
266 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  33.83 
 
 
282 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  33.85 
 
 
266 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  32.69 
 
 
265 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  32.58 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  27.24 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  29.13 
 
 
256 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  31.74 
 
 
166 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  27.14 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  24.51 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  21.21 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  25.76 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  21.97 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  25.84 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  36.54 
 
 
61 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  22.34 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  21.18 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  23.18 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  23.18 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  20.51 
 
 
264 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>