28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2666 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2666  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  32.44 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  35.8 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  34.65 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  29.84 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  29.25 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2039  hypothetical protein  30.89 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0439547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2567  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4230  hypothetical protein  33.6 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101232  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1741  hypothetical protein  31.52 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.15585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  30.35 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7484  putative arylesterase-like protein  33.73 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2500  hypothetical protein  27.52 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475104  normal  0.0433406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  29.38 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  24.81 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  27.68 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  24.6 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  32.29 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3206  hypothetical protein  44.68 
 
 		 61 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>