236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3618 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
296 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  81.08 
 
 
295 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 
267 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
297 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
276 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
268 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 
267 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 
265 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
269 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  34.63 
 
 
260 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  33.47 
 
 
262 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
293 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  31.78 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  32.16 
 
 
249 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
263 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  41.07 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  31.56 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  20.65 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3272  hypothetical protein  31.73 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  23.78 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3502  hypothetical protein  32.06 
 
 
264 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  21.72 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.94 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7128  hypothetical protein  27.45 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314077  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4309  hypothetical protein  22.71 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  27.75 
 
 
524 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
289 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.07 
 
 
286 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  28.57 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
255 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
294 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  28.57 
 
 
359 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 
269 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.33 
 
 
265 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
249 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  28.84 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
257 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.48 
 
 
2762 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5292  hypothetical protein  26.89 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  25.91 
 
 
510 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  27.41 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0780  hypothetical protein  21.89 
 
 
266 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1349  hypothetical protein  24.11 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
276 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 
280 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
273 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3623  hypothetical protein  27.01 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  41.33 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  36.94 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  33.85 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  30.21 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  40.48 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  40.48 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.1 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  40.48 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  33.17 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
273 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>