72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4701 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4701  putative hydrolase protein  100 
 
 
280 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0255091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0642  putative acetone-cyanohydrin lyase  28.81 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0559  Alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.364702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3618  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0740  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4137  Alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0698  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1591  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0103  alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.36 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1914  Alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4729  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0133586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1073  Alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
269 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  28.47 
 
 
408 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2303  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000377537  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  29.56 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1788  hydrolase or acyltransferase  27.95 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000680312  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43025  predicted protein  28.97 
 
 
386 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0408918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1755  hydrolase or acyltransferase  26.22 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1772  lysophospholipase-like protein  19.3 
 
 
222 aa  49.7  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
327 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2020  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0391811  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1657  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1776  hypothetical protein  25.61 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1914  hypothetical protein  25.61 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0234927  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_5097  predicted protein  30.48 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104643  normal  0.482624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  23.47 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.35 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1733  hydrolase or acyltransferase  25 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0207181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4728  arylesterase-related protein  26 
 
 
524 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0151687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
320 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
288 aa  45.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  24.42 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.8 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  24.87 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0578  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3189  alpha/beta hydrolase  28.07 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  28.97 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  26.77 
 
 
336 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  30.23 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  26.92 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5053  hypothetical protein  22.29 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  32.74 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4366  putative esterase  27.59 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.89 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  27.52 
 
 
2648 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1410  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
279 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00336207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  27.16 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
308 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  27.73 
 
 
247 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>