220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3238 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3238  Alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.745191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3176  alpha/beta hydrolase fold  87.21 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0134002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2737  alpha/beta hydrolase fold protein  79.07 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747511  normal  0.973804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  79.46 
 
 		 255 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2257  Alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  65.8 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6162  alpha/beta hydrolase fold protein  67.09 
 
 		 271 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1550  hypothetical protein  56.59 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0203315  hitchhiker  0.00285566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3619  alpha/beta hydrolase fold protein  58.19 
 
 		 286 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  51.01 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  59.09 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  48.94 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0420  putative hydrolase protein  53.25 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00809324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  49.03 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7131  secreted protein  54.51 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000955642  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2730  hypothetical protein  51.27 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2042  alpha/beta hydrolase fold protein  49.15 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6228  secreted protein  46.75 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2275  hydrolase protein  41.87 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  40.45 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  42.35 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0841  hypothetical protein  39.74 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3124  hypothetical protein  40.17 
 
 		 332 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2162  hypothetical protein  41.74 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00663104  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  39.36 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  39.38 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  40 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2628  hypothetical protein  39.6 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1382  hypothetical protein  39.74 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.484877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4007  hypothetical protein  40.08 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2190  hypothetical protein  38.7 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1504  hypothetical protein  39.68 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  38.8 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3673  signal peptide protein  37.5 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0600  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1873  hypothetical protein  42.13 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.875545  normal  0.203455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1452  hypothetical protein  36.24 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.419886  normal  0.505883 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7041  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  41.3 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1078  hypothetical protein  39.37 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.946862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  37.7 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3448  hypothetical protein  39.67 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  37.87 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2444  hypothetical protein  37.3 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  38.15 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5324  hypothetical protein  39.13 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.704501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5268  hypothetical protein  39.26 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744913  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1479  hypothetical protein  37.7 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4716  hypothetical protein  37.39 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  36.86 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  38.86 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3823  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  38.39 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2994  putative secreted protein  35.06 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  36.43 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  37.17 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0370  hypothetical protein  38.56 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2722  hypothetical protein  36.96 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5922  hypothetical protein  36.96 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130853  normal  0.331605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2397  hypothetical protein  35.86 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  37.99 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  36.5 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  38.08 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3614  putative signal peptide protein  37.55 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143133  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  35.16 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0386  putative secreted protein  37.14 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  35.16 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  37.77 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  36.75 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1302  hypothetical protein  37.02 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00400766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1500  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  37.77 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0839932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2823  hypothetical protein  37.69 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.469785  normal  0.411077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3529  hypothetical protein  39.91 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.424455  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  36.68 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  36.47 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  37.34 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  37.18 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28350  hypothetical protein  35.86 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.302341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  37.44 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  38.18 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4030  hypothetical protein  37 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0955  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  36.13 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  34.21 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4902  hypothetical protein  35.83 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  32.17 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3441  secreted protein  37.17 
 
 		 200 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190363  normal  0.109343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  28.92 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  24.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4871  hypothetical protein  32.05 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3294  hypothetical protein  32.05 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  26.61 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  36.45 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  27.42 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  34.85 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  37.96 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>