67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1690 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  39.61 
 
 
209 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  37.38 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  40.39 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  35.15 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  35.95 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  35.84 
 
 
249 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  35.12 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  36.28 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  35.75 
 
 
393 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  35.51 
 
 
216 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  37.07 
 
 
209 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  33.81 
 
 
216 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  34.58 
 
 
245 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  36.06 
 
 
205 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  36.49 
 
 
211 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  34.72 
 
 
221 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  32.72 
 
 
221 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  31.9 
 
 
205 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  32.87 
 
 
254 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  31.72 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  31.8 
 
 
222 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  29.49 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  31.36 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.6 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  27.52 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  29.86 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  29.03 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25.22 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  26.39 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  26.39 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  28.7 
 
 
222 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  25.23 
 
 
325 aa  59.3  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  28.93 
 
 
284 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.35 
 
 
298 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  22.8 
 
 
247 aa  51.6  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  36 
 
 
361 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  36 
 
 
518 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
340 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
343 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3207  hypothetical protein  27.55 
 
 
166 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000208093 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.62 
 
 
286 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1406  Lecithin:cholesterol acyltransferase  32.43 
 
 
362 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
340 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
381 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1595  putative lipoprotein  26.21 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1606  hypothetical protein  31.63 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.379267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  22.07 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  31.73 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  25.24 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  28.57 
 
 
334 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3379  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.397279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3957  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
276 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
346 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
242 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
290 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
272 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.93 
 
 
293 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
278 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
272 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.83 
 
 
425 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
281 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>