233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5508 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  100 
 
 
294 aa  593  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4955  esterase  98.64 
 
 
294 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  92.52 
 
 
294 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  91.16 
 
 
311 aa  533  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  91.16 
 
 
294 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  91.5 
 
 
294 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  88.4 
 
 
294 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  73.08 
 
 
301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  70.86 
 
 
336 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  70.86 
 
 
336 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  70.86 
 
 
301 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  70.86 
 
 
301 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  70.86 
 
 
301 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  70.86 
 
 
301 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  70.86 
 
 
309 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  34.05 
 
 
277 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  38.26 
 
 
320 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  32.98 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  31.16 
 
 
238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.49 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  29.58 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
235 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
240 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  32.97 
 
 
241 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  32.44 
 
 
310 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 
208 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
241 aa  99  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  32.04 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  32.04 
 
 
256 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  32.04 
 
 
256 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  32.2 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.85 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.78 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  34.75 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.24 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  34.75 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  34.75 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  32.62 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  24.66 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  33.33 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  36.88 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  32.64 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  29.39 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  34.29 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  35.94 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  26.67 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.34 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  29.29 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  35.43 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  32.58 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  32.86 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  26.5 
 
 
244 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  30.29 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  26.74 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  30.3 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  30.3 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  33.08 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  26.32 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  29.89 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  25.71 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  25.44 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  27.76 
 
 
252 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  27.14 
 
 
232 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  34.53 
 
 
237 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  30.56 
 
 
224 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  24.37 
 
 
233 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
276 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  33.74 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  26.8 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0489  hypothetical protein  26.13 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.705006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.43 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  25.75 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  27.74 
 
 
264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  24.31 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  26.26 
 
 
245 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  25.84 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  38.46 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.69 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  27.97 
 
 
241 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
242 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  26.5 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3716  hypothetical protein  35.95 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3511  hypothetical protein  25.47 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2532  hypothetical protein  26.74 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>