232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4955 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4955  esterase  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.666917  normal  0.0409605 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5508  esterase  98.64 
 
 		 294 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0202414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0015  esterase  92.52 
 
 		 294 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5176  alpha/beta hydrolase fold  90.48 
 
 		 311 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5683  alpha/beta hydrolase fold  90.48 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198544 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4552  alpha/beta hydrolase fold  90.82 
 
 		 294 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192078  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3171  alpha/beta hydrolase fold  87.37 
 
 		 294 aa  510  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0561096  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2362  esterase EstC  73.08 
 
 		 301 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2104  esterase EstC  70.86 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1492  esterase EstC  70.86 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1132  esterase EstC  70.86 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.120886  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1412  esterase EstC  70.86 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.678673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3278  esterase EstC  70.86 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3164  esterase EstC  70.86 
 
 		 301 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2398  esterase EstC  70.86 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0534637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4939  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00537636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4641  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5732  esterase  38.59 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.668401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1962  esterase EstC  32.98 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  34.42 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.263244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  32.25 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3165  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000928141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  32.49 
 
 		 245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  29.58 
 
 		 235 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2246  hypothetical protein  32.97 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0661824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.88 
 
 		 208 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4997  hypothetical protein  32.06 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  32.39 
 
 		 256 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  32.04 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  32.04 
 
 		 256 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  32.2 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  30.85 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0924  hypothetical protein  29.14 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.196921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2250  hypothetical protein  28.78 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2393  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.507497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38390  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.96 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3028  hypothetical protein  34.75 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.310748  normal  0.0996134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3455  putative esterase  30.11 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0641  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0033841  normal  0.0977111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3013  hypothetical protein  34.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3059  hypothetical protein  34.75 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3533  putative esterase  33.33 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0813292  normal  0.433428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2999  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.049692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3411  putative esterase  31.47 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2687  putative esterase  32.64 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  34.29 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  35.94 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2859  hypothetical protein  35.43 
 
 		 222 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5834  hypothetical protein  27.34 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6062  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4636  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5919  putative esterase  30.17 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  33.33 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0278  putative esterase  26.86 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4708  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  32.86 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0890  hypothetical protein  26.74 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  28.92 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4539  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.390237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4149  hypothetical protein  30.3 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.634975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  33.08 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0222  putative esterase  26.07 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.838594  normal  0.101854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  27.86 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3798  putative alpha/beta hydrolase family protein  26.32 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2278  putative hydrolase protein  27.76 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  25.8 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4027  hypothetical protein  26.26 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1907  hypothetical protein  34.53 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.916544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4620  hypothetical protein  24.73 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5098  hypothetical protein  28.42 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0518544  hitchhiker  0.00455314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  30.56 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2469  esterase/lipase/thioesterase domain-containing protein  26.79 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3112  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2148  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5441  hypothetical protein  26.12 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2713  hypothetical protein  26.97 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4510  putative esterase  26.62 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4596  hypothetical protein  26.51 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0228  hypothetical protein  24.65 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2679  hypothetical protein  27.72 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2733  hypothetical protein  26.86 
 
 		 229 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0661  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  38.46 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0368056  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1996  putative hydrolase protein  32.93 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.639101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3359  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.69 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1696  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  27.97 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2328  signal peptide protein  24.74 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  26.92 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2054  putative hydrolase protein  25.77 
 
 		 252 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.036071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>