More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2530 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  95.95 
 
 		 296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  89.42 
 
 		 294 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  89.83 
 
 		 296 aa  524  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  89.53 
 
 		 296 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  89.53 
 
 		 296 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  85.76 
 
 		 296 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  79.18 
 
 		 298 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  78.57 
 
 		 298 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  78.77 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  72.64 
 
 		 296 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  70.27 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  53.45 
 
 		 302 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  40.27 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 		 304 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  39.65 
 
 		 346 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 		 350 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  39.52 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 343 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 		 337 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 		 349 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 346 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 347 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  38.52 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 		 350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  38.33 
 
 		 348 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  36.04 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  38.6 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  36.63 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 347 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  34.51 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 346 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.85 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  36.01 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 		 456 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 		 444 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  37.81 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  63.37 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  30.41 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 281 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  32.09 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  28 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.98 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.15 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>