More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2386 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 354 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  78.82 
 
 		 347 aa  542  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  70.77 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  65.89 
 
 		 344 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  64.45 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  64.71 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  63.4 
 
 		 347 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  64.33 
 
 		 349 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  63.4 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  64.5 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  63.61 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  63.11 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  65.77 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  64.44 
 
 		 341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  64.94 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  62.65 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  69.02 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  62.32 
 
 		 350 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  67.09 
 
 		 340 aa  437  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  64.22 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  63.11 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  62.68 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  64.79 
 
 		 341 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  65.99 
 
 		 347 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  63.05 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  63.74 
 
 		 348 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  64.72 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  64.43 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  62.13 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  59.09 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  62.54 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 		 346 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  64.43 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  56.61 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  64.98 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  58.26 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  51.99 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  59.27 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  53.08 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 307 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  51.88 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  51.19 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  48.31 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 		 293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  44.26 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  47.93 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 308 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  37.98 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 296 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  37.41 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  37.63 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 293 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  37.15 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  41.44 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.13 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>