More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4572 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
349 aa  694    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  71.04 
 
 
343 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  71.04 
 
 
343 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  68.14 
 
 
348 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  68.55 
 
 
347 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  67.46 
 
 
344 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  69.71 
 
 
453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  65.1 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  64.27 
 
 
352 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  66.57 
 
 
350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  70.59 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  67.75 
 
 
349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  69.71 
 
 
456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  69.71 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  66.18 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  67.63 
 
 
350 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  63.93 
 
 
347 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  65.98 
 
 
350 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  67.17 
 
 
337 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  67.96 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  65.52 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 
347 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.43 
 
 
345 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  63.82 
 
 
350 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  66.06 
 
 
341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  67.85 
 
 
348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  65.09 
 
 
346 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  67.17 
 
 
346 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  72.6 
 
 
340 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  63.42 
 
 
341 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  66.47 
 
 
347 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  63.82 
 
 
346 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  61.98 
 
 
347 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  63.53 
 
 
346 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  62.43 
 
 
354 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  64.18 
 
 
345 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  69.18 
 
 
347 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  58.48 
 
 
347 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 
336 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  58.28 
 
 
364 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  60.48 
 
 
308 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  55.26 
 
 
356 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  54.3 
 
 
307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  54.92 
 
 
305 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  54.64 
 
 
304 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  52.05 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  54.64 
 
 
296 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  52.41 
 
 
293 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
299 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
308 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  47.54 
 
 
305 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 
302 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 
310 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 
310 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 
298 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  37.8 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  37.81 
 
 
298 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
296 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
296 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
296 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  36.62 
 
 
306 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
296 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  37.81 
 
 
294 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  35.11 
 
 
296 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
296 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
296 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
305 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  32.87 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  43.12 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  34.67 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  36.81 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  38.46 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  36.69 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  32.26 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>